DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

5. Diskuze
5.1 Příprava rekombinantního proteinu
Příprava matrixového proteinu pro měření NMR spekter byla optimalizována pro přípravu
divokého typu MA 23 . V případě mutantu T41I/T78I nebylo nutné protokol upravovat, naopak
protein byl i přes to, že mutací byly do molekuly zavedeny dvě hydrofobní aminokyseliny,
lépe rozpustný a NMR vzorek bylo možné zahustit na vyšší koncentraci než v případě divokého
typu. Vysvětlením může být, že isoleucin 41 přispívá ke stabilizaci hydrofobního
jádra proteinu , do kterého je zanořen (Obr. 25), a brání tak ostatním hydrofobním aminokyselinám
v orientaci jejich postranních řetězců na povrch proteinu.
Obr. 25 Hydrofobní kapsa, do které je zanořen isoleucin 41 tvořená aminokyselinami F37,
V38, F45, V59 a F63.
59