Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...

More documents

Recommendations

Info

induced replication; BIR). Kui reparatsiooni protsessist võtavad osa need homoloogsed järjestused, mis asuvad kromosoomi erinevates lookustes, siis võivad tekkida translokatsioonid, duplikatsioonid või deletsioonid, moodustades alternatiivse NAHR tekkemehhanismi (joonis 3b). Joonis 3. Koopiaarvu muutused homoloogilise rekombinatsiooni käigus (Hastings et al., 2009b). a) Ebavõrdne ristsiire NAHR-i käigus moodustub siis, kui rekombinatsiooni reparatsiooni süsteem kasutab homoloogina otseseid kordusjärjestusi (x). Selle tulemusena tekkivad vastavad duplitseeritud ja deleteeritud regioonid järjestuste vahel (y). b) NAHR tekkib BIR mehhanismi kaudu juhul, kui katkenud molekulid kasutavad ektoopilist homoloogiat replikatsioonikahvli taaskäivitamiseks. Deletsioonid ja duplikatsioonid formeeruvad erisündmustel. Kuigi HR on oluline osa DNA reparatsioonil, see on samuti ohtlik sündmus, kuna võib viia kromosomaalsete struktuuride muutuste, kaasa arvatud koopiaarvu variatsioonide tekkele. HR reparatsioonimehhanismid püüavad seda minimeerida, vältides ristsiiret ja reguleerides homoloogia valikut kahe lõigu vahel. Ometi nõuab meioos krossingoveri toimumist ja selle tingimuse mõju avaldub kõrgenenud CNV tekkes meioosi käigus. 2.2. Mittehomoloogne DNA otste liitmine Kuigi arvatakse, et NAHR on CNV-de põhiline tekkemehhanism, ei ole siiski kõik ümberkorraldused inimese genoomis seotud homoloogse rekombinatsiooniga. Mõned genoomsed haigused on seotud hoopis selliste ümberkorraldustega, mille murdepunktid ei asu LCR piirkondades, vaid unikaalsetes järjestustes või erinevates LCR-des. See viitab, et need on tekkinud tõenäoliselt mittehomoloogsete protsesside vahendusel (Shaw and Lupski, 2004). 12
Esimesena pakkusid mittehomoloogset DNA otste liitmist (non-homologous end joining; NHEJ) CNV-de tekkemehhanismina välja Inoue ja tema kolleegid, uurides PLP1 geeni deletsiooni Pelizaeus-Merzbacher haiguse (Pelizaeus-Merzbacher Disease; PMD) patsientidel (Inoue et al., 2002). NHEJ on üks põhimehhanismidest, mida kasutavad eukarüootsed rakud DSB parandamiseks ning mida on kirjeldatud peaaegu kõikides organismides. NHEJ on aluseks juhuslike CNV-de tekkes, ümberkorralduse tekkel murrukohad ei kattu ning seetõttu on ka nende esinemissagedus teatud lookuses harvem -
Page 1 and 2: TARTU ÜLIKOOL LOODUS- JA TEHNOLOOG
Page 3 and 4: Sissejuhatus Inimese genoomi lõpli
Page 5 and 6: 1. Koopiaarvu variatsioonid: fenome
Page 7 and 8: valikule ja geneetilise triivile. K
Page 9 and 10: Joonis 1. Genoomsete ümberkorraldu
Page 11: ka olla aluseks sellistele erinevus
Page 15 and 16: mehhanism - replikatsioonikahvli pe
Page 17 and 18: MMBIR võib põhjustada erinevate s
Page 19 and 20: 3.1. Genotüüp-fenotüüp suhe Fen
Page 21 and 22: inversioon vanemate kromosoomis soo
Page 23 and 24: meetod, mille lahutusvõime on prae
Page 25 and 26: mõnede indiviidide puhul sõltub t
Page 27 and 28: 4.2.2. Multipleks ligeeritavate pro
Page 29 and 30: Kokkuvõte Viimaste aastate jooksul
Page 31 and 32: Kirjanduse loetelu A) Ajakirjad Arm
Page 33 and 34: Nobile, C., Toffolatti, L., Rizzi,

Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?