Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Kokkuvõte<br />
Viimaste aastate jooksul on meie teadmised <strong>koopiaarvu</strong> <strong>variatsioonid</strong>e kohta oluliselt<br />
suurenenud tänu inimese genoomi lõplikule sekveneerimisele <strong>ja</strong> HapMap projektile.<br />
Tänapäeval on loodud mitmed andmebaasid <strong>koopiaarvu</strong> <strong>variatsioonid</strong>e kirjeldamiseks. Nende<br />
andmete analüüsil sai selgeks, et CNV-de levik inimeste genoomis on üsna lai, kusjuures suur<br />
osa CNV-dest võib olla seotud ebanormaalse fenotüübi kujunemisega. CNV-d võivad esile<br />
kutsuda sporaadiliste haiguste, mendeliaalsete või kompleksete tunnuste tekket, mõjutades<br />
geeni doositundlikust, lõhkudes geene või põhjustades positsioonilist efekti. Viimase kümne<br />
aasta jooksul on suuresti tänu mikrokiipide kasutamisele leitud ligikaudu 10-20%<br />
arenguhäirete puhul, mille põhjus oli patsientidele <strong>ja</strong> <strong>nende</strong> peredele varem teadmata, et<br />
haigusfenotüüp on tingitud submikroskoopilisest <strong>DNA</strong> <strong>koopiaarvu</strong> muutvast aberratsioonist.<br />
Uuringute tulemuste põh<strong>ja</strong>l pakuti, et CNV-d vastutavad põhilise osa geneetiliste <strong>ja</strong><br />
fenotüübiliste <strong>variatsioonid</strong>e eest, erinevalt varasematest uuringutest, mille alusel peeti<br />
<strong>variatsioonid</strong>ega suuremal määral seotuks SNP-sid. Tänu uurimismeetodite kiirele arengule<br />
on pakutud kolm peamist mehhanismi, mille toimumisel leiab aset <strong>koopiaarvu</strong> variatsiooni<br />
formeerumine: rekombinatsioonipõhised mitte-alleelne homoloogiline rekombinatsioon <strong>ja</strong><br />
mittehomoloogne <strong>DNA</strong> otste liitmine ning suhteliselt uus replikatsioonipõhine mehhanism –<br />
replikatsioonikahvli peatumine <strong>ja</strong> matriitsi ümberlülitus/mikrohomoloogia vahendatud<br />
katkestusest indutseeritud replikatsioon. Põh<strong>ja</strong>likud CNV kaardid pakuvad huvi ka<br />
evolutsiooni uuri<strong>ja</strong>te <strong>ja</strong>oks. Arvatakse, et CNV võivad olla põhiline jõud inimese genoomse<br />
evolutsiooni kujunemisel, viides geene duplikatsioonile <strong>ja</strong> eksonite ümber paigutamisele.<br />
Samas on suur osa <strong>koopiaarvu</strong>ga seotud muutustest veel avastamata, seda eelkõige just<br />
väiksemate - mõnekümne kuni paarisa<strong>ja</strong> aluspaari pikkuste CNV-de osas. Seega võimaldavad<br />
edasised uuringud meetodite täiustumisel <strong>ja</strong> lahutusvõime paranemisel detailsemalt uurida<br />
CNV-de tekkemehhansime <strong>ja</strong> <strong>nende</strong> muutuste aluseks olevate ümberkorralduste mõju seal<br />
asuvatele geenidele <strong>ja</strong> <strong>nende</strong> regulaatorjärjestustele. Aru saamine sellest, kuidas CNV-de<br />
formeerumise mehhanismid toimivad molekulaarsel tasemel võimaldab leida rohkem<br />
regioone, mis on vastuvõtlikud ümberkorraldustele, seega on see väga perspektiivne suund<br />
kliniliistel molekulaardiagnostika arenemisel <strong>ja</strong> ravimeetodite määramisel.<br />
29
Change language