Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Joonis 1. Genoomsete ümberkorralduste tekke. (Gu et al., 2008)<br />
LCR-ide asukoht samas kromosoomis <strong>ja</strong> samas orientatsioonis põhjustab<br />
deletsiooni/duplikatsiooni (vasakul). Kui orientatsioon on vastupidine, põhjustab NAHR<br />
inversiooni.<br />
Lisaks LCR järjestustele võivad NAHR substraatidena esineda ka sellised kordusjärjestused<br />
nagu retrotransponeeritavad elemendid L1, Alu elemendid või transposoonide-sarnased <strong>ja</strong><br />
teised potentsiaalsed cis-rekombinogeensed järjestused. Selliseid elemente leidub inimese<br />
genoomis suurel hulgal <strong>ja</strong> mõned neist kutsuvad esile kaheahelalisi <strong>DNA</strong> katkestusi, mis on<br />
rekombinatsiooni toimumise eelduseks. Eriti tundlikud on meiootiliste paardumisvigade<br />
suhtes Alu-järjestused. Kuna need kordusjärjestused on üsna väiksed, siis on <strong>nende</strong>vahelise<br />
NAHR-i tulemusena ümberpaiknenud <strong>DNA</strong> fragmendid ka suhteliselt lühikesed (Zhang et al.,<br />
2009).<br />
Tavaliselt tekib NAHR meioosis ebavõrdse ristsiirde tulemusel, mis viib genoomsete<br />
ümberkorralduste tekkele. <strong>DNA</strong> struktuuri muutus võib olla kas päriliku haiguseni viiv geeniviga,<br />
hulgitegurilisele haigusele vastuvõtlikuks muutev variatsioon või neutraalne<br />
polümorfism. Meioosi käigus võib NAHR toimuda kahe paraloogse järjestuse vahel, mis<br />
asuvad kas samal kromatiidil (intrakromatiidne), tütar-kromatiididel<br />
(intrakromosomaalne/interkromatiidne) või homoloogsetel kromosoomidel<br />
(interkromosomaalne). Interkromatiitsed <strong>ja</strong> interkromosomaalsed ümberkorraldused kahe<br />
samas orientatsioonis oleva kordusjärjestuse vahel viivad deletsiooni või duplikatsiooni<br />
tekkele, samas kui intrakromatiidsete ümberkorralduste tulemusel tekivad ainult<br />
9
Change language