Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
mehhanism – replikatsioonikahvli peatumine <strong>ja</strong> matriitsi ümberlülitus (Fork Stalling and<br />
Template Switching; FoSTeS). Vastavalt sellele mudelile peatub <strong>DNA</strong> replikatsiooni käigus<br />
<strong>DNA</strong> replikatsioonikahvel teatud positsioonil (näiteks, <strong>DNA</strong> juuksenõelastruktuuri<br />
kohtamisel), replikatsioonikompleks tuleb sünteesitavalt <strong>DNA</strong> ahelalt lahti <strong>ja</strong> liitub teise<br />
läheduses asuva aktiivse replikatsioonikahvliga, kopeerides <strong>DNA</strong> järjestust ühest ahelast<br />
teisse. (joonis 5). Kordusjärjestuste piirkonnad moodustavad <strong>DNA</strong>-s anomaalseid<br />
sekundaarstruktuure, mille abil <strong>DNA</strong>-polümeraas võib replikatsiooni a<strong>ja</strong>l sünteesida uude<br />
<strong>DNA</strong> ahelasse suurema hulga kordusjärjestusi, kui neid on komplementaarses ahelas.<br />
Selliseks ümberlülitamiseks on piisav isegi 4-15bp mikrohomoloogia <strong>ja</strong> selle tulemusena ei<br />
teki murdepunkt, vaid nn „liite-punkt“ (joint-point) (Lee et al., 2007). Ümberlülitamine<br />
kahvlile, mis asub allavoolu (edaspidine invasion) annab deletsiooni, samas kui<br />
ümberlülitamine kahvlile, mis asub ülesvoolu (tagurpidine invasion) lõpeb duplikatsiooniga.<br />
Huvitav on see, et protsess võib toimuda mitu korda järjest (FoSTes x 2, FoSTes x 3 jne.), mis<br />
peegeldab <strong>DNA</strong> polümeraasi viletsat efektiivsust ning põhjustab komplekseid<br />
kromosomaalseid ümberkorraldusi. Kuna FoSTes on replikatsioonil põhinev protsess,<br />
arvatakse, et see toimub mitoosis, erinedes seega NAHR <strong>ja</strong> NHEJ mehhanismidest, mille<br />
aluseks on pigem meiootilised rekombinatsiooni mehhanismid.<br />
Joonis 5. Replikatsioonikahvli peatumine <strong>ja</strong> maatritsi ümberlülilatime (Hastings et al.,<br />
2009b).<br />
Pal<strong>ja</strong>s üksikahelalise mahajääva <strong>DNA</strong> template (a) võib omandada sekundaarse struktuuri,<br />
mis blokeerib replikatsioonikahvli edasi liikumise (b). 3’ots vabaneb maatritsist (c) ning<br />
lülitub ümber teisele ahelale, genereerides selllega genoomseid ümberkorraldusi.<br />
Aastal 2009 avaldati Hastings`i <strong>ja</strong> kaastööta<strong>ja</strong>te poolt artikkel mehhanismist, mis on lähedane<br />
FoSTeS mehhanismiga ning mida nimetatakse Mikrohomoloogia vahendatud katkestusest<br />
indutseeritud replikatsiooniks (Microhomology-mediated Break Induced Replication;<br />
MMBIR). Seda mehhanismi kasutatakse üksikahelaliste katkestatud otste parandamiseks, kui<br />
üksikahelalised <strong>DNA</strong> (single-stranded <strong>DNA</strong>; ss<strong>DNA</strong>) otsad on kättesaadavad <strong>ja</strong> omavad<br />
15
Change language