Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
Inimese DNA koopiaarvu variatsioonid: nende tekkemehhanismid ja ...
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
MMBIR võib põhjustada erinevate struktuursetee ümberkorralduste teket (Tabel 1):<br />
1. Translokatsioonid tekivad, kui ümberlülitamine toimub teisele kromosoomile;<br />
ümberlülitamine kas teisele tütar-kromatiidile või homoloogile pöördorientatsioonis<br />
annaks inverteeritud kromosomaalse segmendi;<br />
2. Duplikatsioonid tekivad, kui ümberlülitamine toimub kas tütar-kromatiidi või<br />
homoloogi replikatsioonikahvli murdpunktist tahapoole ning<br />
3. Deletsiooni puhul replikatsioonikahvli murdepunktist ettepoole.<br />
4. Kui ümberlülitus toimub järjestusele, mis eelnevalt oli juba duplitseerunud, on<br />
tulemuseks triplitseerunud piirkond.<br />
5. Juhul aga, kui ümberlülitus toimub samal molekulil replikatsioonikahvli murdpunktist<br />
tagapool, võib see käivitada „veereva ratta“ replikatsiooni ning antud piirkonda<br />
amplifitseerimise.<br />
MMBIR mehhanism mõjutab bioloogilisi protsesse inimesel mitmel tasandil. Esiteks,<br />
rakutasemel võib mehhanism olla aluseks sündmustele, mis põhjustavad pahaloomuliste<br />
kasva<strong>ja</strong>te teket <strong>ja</strong> progresseerumist. Teiseks, organismitasemel võib MMBIR luua LCRjärjestusi,<br />
mis on eelduseks NAHR-i toimumisele, <strong>ja</strong> seega soodustab CNV-de teket ning<br />
<strong>nende</strong>ga seotud genoomsete häirete, eeskätt mikrodeletsiooni <strong>ja</strong> –duplikatsiooni sündroomide<br />
teket (Hastings et al., 2009a).<br />
Tabel 1. MMBIR-i vahendatud maatritsi ümberlülitamise kromosomaalsed tagajärjed.<br />
(Hastings et al., 2009a)<br />
Ümberlülitamise koht:<br />
Tulemus:<br />
Tütarkromatiidile või homoloogile replikakatsioonikahvlist tahapoole Duplikatsioon<br />
Tütarkromatiidile või homoloogile replikakatsioonikahvlist ettepoole Deletsioon<br />
Tütarkromatiidile või homoloogile, mis asub vastupidises orientatsioonis Inversioon<br />
Mittehomoloogsele järjestusele<br />
Translokatsioon<br />
Järjestusele, mis oli juba duplitseerunud<br />
Triplikatsioon<br />
Sama molekulile murdpunktist tahapoole "Veerava ratta"<br />
replikatsioon<br />
3. Koopiaarvu <strong>variatsioonid</strong>e mõju inimese genoomile<br />
CNV-de mõju genoomi tasandil sõltub muutuste iseloomust, ulatusest <strong>ja</strong> asukohast (joonis 7)<br />
(Lee and Scherer, 2010):<br />
A) Koopiaarvu muutus võib mõjutada funktsionaalsete geenide arvu läbi terve või osalise<br />
deletsiooni või duplikatsiooni. Tulemuseks on kas geeni inaktiveerimine (“loss-of-<br />
17
Change language