Abschlussbericht - Abteilung Mykologie - Universität Bayreuth

GBIF-D
IT-Fachgruppe Abschlussbericht Januar 2008
Bei Ontologien handelt es sich nach der Definition von Dr. H. Schentz um Thesauri
(controlled vocabularies) mit Relationen zwischen Begriffen (Konzepten), wodurch
die Begriffe wechselseitig erklärt werden. Unterschiedliche Daten können nur zusammengeführt
und gemeinsam ausgewertet werden, wenn ausreichend Metadaten
zur Verfügung stehen. Diese Metadaten müssen in einer gemeinsamen Sprache beschrieben
sein. Ontologien in OWL/RDFS und Daten in RDF sind eine gute formale
Basis dafür. Ontologien sind erweiterbar, neue Relationen können eingefügt werden,
ohne bestehende Strukturen zu zerstören.
Seit Oktober 2006 wird zudem eine Ontologie für TDWG und GBIF entwickelt
(http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/TAG/TDWGOntology). Der TAPIR Wrapper kann
für eine semantische Vernetzung verwendet werden, doch Portale zur semantischen
Vernetzung bestehen noch nicht.
MORIS hat 3 grobe Rollen für die Datenauswahl: Powerselection (Freie Zusammenstellung
der Selektionskriterien; für Experten der Oberfläche und des Inhalts), Simple
Selection (Vorgefertigte Teilmenge mit vorgefertigten Einschränkungsmöglichkeiten),
Durchführen einer fertigen Selection (Jede Auswahl ist speicherbar und kann mit einem
Knopfdruck ausgeführt werden).
Wichtig für eine Anwendung im Projekt Biodiversitäts-Exploratorien wäre eine sorgfältige
Definition der „core ontology“. Dieser Prozess ist dabei sicherlich der aufwändigste
und es müssen dafür alle Disziplinen eingebunden werden. Bei der Entwicklung
der „core ontology“ sollte auf die bestehenden Ontologien von TDWQ und
MORIS zurückgegriffen werden.
Das System MORIS könnte jederzeit verwendet werden, ist in der jetzigen Version
jedoch an Oracle gebunden, soll aber ab Version 2.x weniger abhängig vom DBMS
sein. Die Entwickler orientieren sich mehr in Richtung PostgreSQL.
Betont wurde noch einmal, dass nur eine direkte Verknüpfung der Metadaten mit den
Daten eine Automatisierung von Prozessen möglich macht. Aggregationen von Daten,
Datentypkonvertierungen und Datenvergleiche sind nur möglich wenn wirklich
detaillierte Metadaten erhoben wurden. Der Mehrwert dieser zunächst aus Sicht der
Nutzer zusätzlichen Arbeit muss klar erkennbar sein. Eine Festlegung auf bestimmte
Formate ist dabei unumgänglich.
Gemeinsame Semantiken für verschiedene Disziplinen sind von großer Bedeutung,
denn Definitionen können wieder verwendet werden (z.B. bei der Laborarbeit). Methoden
werden normalerweise länger beibehalten. Hier ist aber auch zu bedenken,
dass in manchen Disziplinen (z.B. Vegetationskunde) die angewandte Methode
durchaus vom Anwender abhängig sein kann. Eine Einigung auf wenige gemeinsam
verwendete Methoden wird im Projekt Biodiversitäts-Exloratorien als nicht realistisch
angesehen.
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