Abschlussbericht - Abteilung Mykologie - Universität Bayreuth

GBIF-D
IT-Fachgruppe Abschlussbericht Januar 2008
• Da die Daten aus diesem Projekt gemäß der Berliner Erklärung
http://oa.mpg.de/openaccess-berlin/berlindeclaration.html) zumindest mittelfristig
Wissenschaftlern als auch der Öffentlichkeit zugänglich zu machen sind,
ist auf die Nachhaltigkeit der zu etablierenden IT-Strukturen größten Wert zu
legen.
Nachträgliche Einfügungen, die nicht Gegenstand der Diskussion waren
• Es bestünde die Möglichkeit die bereits bestehenden Entwicklungen alle zentral
in Jena zu installieren. Dabei besteht jedoch ein gewisses Problem darin,
dass existierende und potentiell verfügbare Schnittstellen in unterschiedlichen
Sprachen programmiert sind. Eine Portierung bestehender Schnittstellen erscheint
dabei als eine durchaus sinnvolle Option.
• Die Datenbank aus dem SFB 607 (Projekt C7) kann neben Metadaten auch
Primärdaten verwalten, welche auch durch Data-Mining ausgewertet werden
können (http://www.sfb607.de/english/projects/c7/c7.html)
Angebote zur Kooperation zur Abdeckung bestimmter Datenbereiche
Kernkonzept Biodiversitätsexploratorien (J. Nieschulze, Dr. S. Pfeiffer)
Das Informationssystem der Biodiversitätsexploratorien soll die zentrale Erfassung
und den Zugang zu den Daten sicherstellen. Zusätzlich soll eine Verknüpfung, Aggregierung,
statistische Analyse und Visualisierung der Daten bereitgestellt werden.
Besondere Bedeutung wird hier der Verknüpfung von Daten über verschiedene
räumliche und zeitliche Skalen eingeräumt. Die Visualisierung umfasst sowohl Darstellungen
in Karten als auch Methoden der explorativen Datenanalyse.
Die technische Umsetzung sieht einen modularen Systementwurf mit einer XMLbasierten,
serviceorientierten Architektur (SOA) vor, auf die mittels einer einfachen
Web Schnittstelle zugegriffen wird. Bei den Services liegt die Priorität auf dem Einsatz
und der Kompatibilität von anerkannten Standards wie GML des OGC und Bio-
Case und ABCD.
Für das Zusammenführen und die Analyse von Daten ist deren korrekte Interpretation
Grundvoraussetzung. Vor diesem Hintergrund findet zur Zeit eine Metadaten-
Schemaentwicklung mit den beteiligten Disziplinen statt. Zum einen sollen mit diesem
Schema die Festlegung von Datenformaten und deren inhaltliche Struktur erfolgen.
Vorgesehen sind ASCII und eindeutig strukturierte Excel-Dateien. Das Schema
soll dabei eine Anzahl von Strukturen (z.B. horizontale oder vertikale Ausrichtung der
Variablen) unterstützen und enthält auch Angaben zur Interpretation der Daten. Zum
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