Abschlussbericht - Abteilung Mykologie - Universität Bayreuth
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GBIF-D<br />
IT-Fachgruppe <strong>Abschlussbericht</strong> Januar 2008<br />
Messungendatenbank (O. Archner)<br />
Für den Austausch zwischen Wissenschaftlern betreibt das BayCEER eine Datenbank<br />
zur Speicherung von Umweltmessreihen.<br />
In Kombination mit dem Klienten „GOAT“ und mehreren ETL (Extraction-, Transformation-<br />
and Loading) Modulen deckt sie den gesamten Prozess von der automatischen<br />
Datenerfassung im Feld bis hin zur Qualitätssicherung von Messreihen ab.<br />
Die Arbeitsgruppe Datenbanken des BayCEER bietet den Einsatz der Datenbank zur<br />
Speicherung von Zeitreihen im Verbundprojekt an. Eine Anpassung der Software an<br />
speziellen Anforderungen ist möglich. Bei Bedarf können fehlende Schnittstellen<br />
(z. B. BioCASE) durch Mitarbeiter der Arbeitsgruppe realisiert werden.<br />
Sammlungs- und Beobachtungsdaten (Dr. D. Triebel)<br />
Das IT Zentrum an den Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns<br />
entwickelt generische Software im Bereich Biodiversitätsdaten (siehe z.B.<br />
http//:www.snsb.info, http//:www.diversityworkbench.net) und vertritt als IT-technische<br />
<strong>Abteilung</strong> zwei Deutsche GBIF-Knoten (<strong>Mykologie</strong> und Evertebrata II, siehe<br />
http//:www.gbif.de).<br />
Für das Verbundprojekt DFG exploratories könnte speziell die Datenbank-Applikation<br />
DiversityCollection (sowie assoziierte Applikationen, mit .Net Client) zur Erfassung<br />
und Prozessierung von Sammlungs- und Beobachtungsdaten von zentralem Interesse<br />
sein und auch bereitgestellt werden. Zusätzliche Bedürfnisse, z. B. hinsichtlich<br />
projektspezifischer Import- und Exportfunktionen, könnten in Kooperation mit der IT-<br />
<strong>Abteilung</strong> des Verbundprojektes verwirklicht werden. Sinnvoll wären wohl verteilte<br />
Installationen je nach den Anforderungen der Einzelprojekte.<br />
Inwieweit weitere in Entwicklung befindliche Softwarekomponenten der Diversity<br />
Workbench (z.B. zur Erfassung beschreibender, ökologischer Daten oder taxonomischer<br />
Daten) für die Teilprojekte von Interesse sind, müsste am konkreten Fall analysiert<br />
werden.<br />
Wrapper (A. Güntsch, J. Holetschek)<br />
1. Unterstützung bei Installation, Konfiguration und Betrieb der BioCASE Provider<br />
Software ("Wrapper")<br />
Wie im Workshop angedeutet wurde, könnte der Austausch der im Projekt erfassten<br />
primären Biodiversitätsdaten sowie deren Anbindung an das GBIF-Netzwerk mithilfe<br />
der am BGBM entwickelten BioCASE Provider Software (PyWrapper) erfolgen. Die<br />
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