Abschlussbericht - Abteilung Mykologie - Universität Bayreuth

GBIF-D
IT-Fachgruppe Abschlussbericht Januar 2008
TDWG und eine CODATA Taskgroup (http://www.bgbm.org/tdwg/codata/) entwickelt
und wird insbesondere durch BioCASE (http://www.biocase.org) und GBIF
(http://www.gbif.org) gefördert.
Mit hunderten von Datenelementen deckt es Lebendsammlungen, konservierte
Sammlungen und Beobachtungen aller taxonomischen Gruppen ab. Um Haltern von
Sammlungsdatenbanken die Konfigurierung ihrer ABCD Netzwerksoftware zu erleichtern
wurden Datenbereiche, von denen man annimmt, dass sie häufig in Datenbanken
nicht ausreichend atomisiert wurden, sowohl atomisiert als auch als Freitext
repräsentiert (variable Atomisierung). Zusätzlich wurde weitgehend auf den Einsatz
kontrollierter Vokabulare und regulärer Ausdrücke verzichtet.
Da ABCD ausdrücklich nur Sammlungsdaten abdeckt, integrieren Biodiversitäts-
Netzwerke ABCD Sammlungsdienste mit anderen Diensten. Der BioCASE / GBIF-D
Prototyp nutzt zum Beispiel einen Registrierungsservice mit einer Indexdatenbank
um ABCD Datenanbieter für eine konkrete Anfrage zu identifizieren. Synonyme werden
mit einem taxonomischen Thesaurus mit in die Suche einbezogen. Verweisen
die zurück gelieferten ABCD Dokumente auf Bilddaten, so werden diese mit einem
speziellen Bild-Server dargestellt. Darüber hinaus können geographische Koordinaten
von Fundorten über einen Service zur Erstellung von Verbreitungsdaten visualisiert
werden.
Daten und Datenflüsse in GBIF-D Botanik
Andrea Hahn
Der botanische Knoten von GBIF-D besteht aus zehn Teilprojekten, die neben der
Datendigitalisierung selbst die Anbindung existierender und zu schaffender Datenbanken
an ein gemeinsames Zugangssystem zum Ziel haben. Der gegenwärtige
Schwerpunkt geförderter Projekte liegt auf Referenz- und Typussammlungen vorwiegend
in Herbarien, zu denen ein Zugang in Form des „Deutschen Virtuellen Herbariums“
geschaffen wird. In jedem Fall sollen jedoch auch die anderen Disziplinen im
botanischen Bereich (Phytodiversitätsforschung, Taxonomie, pflanzengenetische
Ressourcen, Botanische Gärten) angemessen berücksichtigt und über ein gemeinsames
Portal zugänglich gemacht werden. Dies bedeutet eine Zusammenführung
von Beobachtungs- und Objektdaten sowie von taxonomischer (konzeptbasierter)
Information, von Bild- und Textdaten, sowie die Schaffung von Kommunikationsstrukturen
sowohl zwischen den beteiligten Projekten und Datenhaltern als auch zwischen
Datenhaltern und Nutzern des Systems im Internet (Feedback).
Der Grundansatz folgt dabei dem von GBIF International propagierten Prinzip der
dezentralen Datenhaltung: Datenbanken verbleiben bei ihren Erzeugern und werden
über ein allgemeines Zugangssystem über das Internet abfragbar gemacht. Da sowohl
die zugrunde liegende Technik als auch Datenbanksoftware und -strukturen
typischerweise sehr heterogen sind, wird dabei der BioCASE-Ansatz angewendet,
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