Waleo 3 : Déclarations d'intention (PDF) - Recherche et Technologie

Waleo 3 Déclarations d’intention
Acronyme : LungMarker
Titre : Application de l’approche métabolomique à la découverte de nouveaux outils diagnostiques dans le domaine des
pathologies respiratoires
Durée : 48 mois
Promoteur : Bernard Pirotte, Université de Liège
Coord. scient. : Pascal de Tullio (+ 32 4 366 43 69)
Partenaire n˚1 : Prof. Alfred Bernard
Unité de Toxicologie Industrielle et de Médecine du Travail
Université Catholique de Louvain
Partenaire n˚2 : Prof. Bernadette Govaerts
Institut de statistique
Université Catholique de Louvain
Partenaire n˚3 : Dr. Patrice Chiap
A.T.C. (Advanced Technology Corporation)
C.H.U. de Liège
Partenaire n˚4 : Dr. Pilippe Delahaut
Laboratoire d’hormonologie
Centre d’Economie Rurale (CER) de Marloie
Parrain n˚1 : ZenTech
Dr. Jean-Claude Havaux
Parrain n˚2 : L.T.S. (Lung Therapy Systems)
Dr. Didier Cataldo
Résumé
Les pathologies respiratoires, en particulier celles développées chez l’enfant,
telles que les affections respiratoires liées à une exposition aux polluants
atmosphériques, restent un domaine de la santé publique pour lequel
nous manquons actuellement d’outils diagnostiques spécifiques. Le but de
ce projet est d’identifier par l’approche métabolomique des biomarqueurs
de ces pathologies respiratoires et d’utiliser ceux-ci dans la confection et la
validation d’outils diagnostiques commerciaux.
Le métabolome peut être vu comme l’ensemble des produits finaux provenant
de l’expression des gènes, à savoir comme l’ensemble des métabolites
produits par les cellules dans des conditions spécifiques. L’évaluation qualitative
et quantitative du métabolome fournit donc une vue générale du
statut biochimique de l’organisme, qui peut être utilisée pour visualiser la
fonction des gènes. La "métabolomique" est donc l’étude de l’ensemble
des composés de faible masse moléculaire présents dans une cellule, un
organe, un organisme et biosynthétisés par celui-ci. Actuellement, aucune
technique analytique ne permet de profiler réellement l’ensemble du métabolome
à elle seule et, dès lors, une combinaison de celles-ci s’impose.
Les méthodes les plus couramment utilisées sont la chromatographie (liquide
ou gazeuse), la spectrométrie de masse (SM) et la spectrométrie de
résonance magnétique nucléaire (RMN) à haut champ. En tenant compte
d’exigences telles que vitesse, sélectivité, reproductibilité et sensibilité, la
spectroscopie RMN du proton est généralement acceptée comme une approche
analytique de choix en métabolomique. Bien que peu sensible, cette
technique est cependant très reproductible. Elle permet de couvrir la plus
grande part des métabolites et elle doit faciliter la détermination de structure
de métabolites inconnus ou inattendus. Cependant, il apparaît nécessaire
de confronter les résultats obtenus en RMN avec ceux générés par
d’autres techniques analytiques telles que la chromatographie liquide (CL)
couplée à la spectrométrie de masse (SM), technique très sensible qui permet
la détection de métabolites présents à l’état de traces.
L’approche métabolomique est actuellement en plein développement dans
de très nombreux domaines de la recherche biomédicale et biopharmaceutique
et ce, notamment, en vue de l’identification de biomarqueurs spécifiques
de toxicité tissulaire ou caractéristiques de certaines pathologies. La
comparaison des profils métaboliques obtenus à partir de biofluides (urine,
sérum, liquide céphalo-rachidien) de patients "sains" et "atteints d’une pathologie"
doit permettre d’identifier des biomarqueurs caractéristiques de
cette pathologie.
Disposant d’un appareil RMN à haut champ (500 MHz) dans le Centre
Interfacultaire de Recherche du Médicament (CIRM - ULg) et de spectromètres
de masse performants au sein de la société A.T.C., il nous est apparu
extrêmement intéressant de développer l’approche moderne et prometteuse
de la métabolomique autour d’un projet associant applications cliniques et
diagnostiques. Concrètement, le projet prévoit d’appliquer cette approche
à la découverte de nouveaux outils diagnostiques dans le domaine des pathologies
respiratoires.
L’Unité de Toxicologie de l’UCL spécialisée dans l’identification de biomarqueurs
de l’atteinte pulmonaire ou rénale est en mesure de fournir un
très grand nombre d’échantillons de fluides non-invasifs provenant de sujets
sains et de patients atteints de pathologies respiratoires. Des modèles
animaux d’atteintes respiratoires (UCL et ULg) permettront de compléter
l’approche métabolomique dans la mesure où ils constituent une population
contrôlée fournissant des échantillons de biofluides plus homogènes.
L’analyse statistique et stochastique des données spectrales obtenues à partir
de différents biofluides sera assurée par le concours de l’Institut de statistique
de l’UCL.
Les biomarqueurs identifiés pourront faire l’objet de la mise au point et
de la validation de kits commerciaux (outils diagnostiques ou prédictifs de
pathologies respiratoires).
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