Waleo 3 : Déclarations d'intention (PDF) - Recherche et Technologie

Waleo 3 Déclarations d’intention
Acronyme : VIRUSENSOR
Titre : Développement d’un senseur spécifique des infections virales
Durée : 48 mois
Promoteur : Daniel Desmecht, Université de Liège
Coord. scient. : Daniel Desmecht (04/ 366 4075)
Parrain n˚1 : ProGenosis, Fabrizio Gianotta
Résumé
Trois cents trente-cinq maladies émergentes ont été recensées au sein de la
population humaine mondiale entre 1940 et 2004 (Jones et al., Nature 451 :
990-3, 2008). Environ 40% d’entre elles sont dues à de nouveaux virus,
surtout des virus à ARN (HIV, SRAS, H5N1, Nipah, Hendra, West Nile,
Chikungunya, Hantaan, etc). Ce contexte microbiologique est voué à durer
puisqu’il est associé à la mondialisation des échanges, à la massification des
déplacements internationaux de personnes et au changement climatique. En
conséquence, la profession médicale est confrontée à la nécessité de diagnostiquer
un éventail de plus en plus large de maladies infectieuses. Relever
ce défi suppose la mise en place de nouveaux moyens. En effet, l’acquisition
d’une bonne connaissance de toutes les maladies infectieuses existant
dans le monde n’est pas à la portée de la plupart des médecins. D’autre part,
l’élargissement sans précédent du diagnostic différentiel érode le potentiel
discriminant des données anamnestiques, de l’examen clinique et des tests
de biologie clinique classiques. Pour répondre à ce défi, de gros efforts
ont été menés pour élaborer des systèmes informatiques susceptibles de
fournir une aide au diagnostic (GIDEON, par exemple). Quoique ces systèmes
connaissent une amélioration constante, la pierre angulaire du diagnostic
repose avant tout sur la disponibilité de marqueurs discriminants. Le
projet vise à valider un marqueur sanguin capable de détecter spécifiquement
la présence d’une infection virale de l’être humain quel que soit le
virus concerné - fût-il inconnu - ce qui implique, en creux, que ce biomarqueur
permettra également, le cas échéant, d’exclure l’intervention d’un
virus quelconque, donc d’orienter le diagnostic différentiel vers les infections
bactériennes, parasitaires ou fongiques. Dans la foulée, le projet vise
à développer un processus performant permettant le dosage de ce marqueur
et à fabriquer des supports de diagnostic susceptibles d’être mis en oeuvre
dans les laboratoires de biologie clinique de routine. Sur le fond, le projet
repose sur l’observation que toute infection virale débutante suscite systématiquement
la production d’interférons de type 1. Comme le dosage de
ces interférons dans le sang est difficile (tant pour des raisons techniques
que biologiques) et très onéreux, leur utilisation comme biomarqueur utilisable
en routine pour diagnostiquer une infection virale n’a jamais été
concrétisée. Dans ce contexte, le projet consiste à exploiter, en tant que
biomarqueur, une GTPase dynamine-like inductible (# AAH32602) qui est
exprimée rapidement et en grandes quantités en présence d’IFNs et dont
la demi-vie longue est favorable au diagnostic. La première étape du projet
consistera à purifier la protéine visée afin de se donner les moyens de
développer des ligands appropriés pour le diagnostic. Ces ligands seront
dûment protégés afin de favoriser leur exploitation ultérieure par le tissu industriel
wallon. Un premier support de dosage sera ensuite produit à l’aide
de ces ligands (ELISA). D’autre part, pendant toute la durée du projet, une
banque de donnée sera construite, qui associera à chaque concentration sanguine
du marqueur visé - mesurée par le kit ELISA précité - le faisceau de
données anamnestiques, cliniques, biologique et microbiologique qui lui
correspond. L’analyse de cette banque de données permettra d’établir les
valeurs de référence de la concentration sanguine du marqueur visé chez
l’homme sain, en fonction du sexe, de l’âge, du statut physiologique et de
l’origine ethnique. La banque de données permettra ensuite (i) de valider
le statut de biomarqueur de la protéine précitée pour une série de maladies
virales, (ii) d’exclure toute augmentation du taux sanguin de ce marqueur
dans le cas de maladies infectieuses non virales, voire (iii) de découvrir certaines
maladies non infectieuses susceptibles d’être détectées précocement
par le biomarqueur visé. (. . . )
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