Waleo 3 : Déclarations d'intention (PDF) - Recherche et Technologie

Waleo 3 Déclarations d’intention
Acronyme : NOSOSCAN
Titre : Développement d’antibody-Arrays dédicacé aux infections à Staphylocoque
Durée : 48 mois
Promoteur : Moreno GALLENI, Université de Liège
Coord. scient. : Moreno GALLENI (04 366 35 49)
Partenaire n˚1 : Alfred, COLLARD, Laboratoire d’Immunologie et de Virulogie animale du Centre d’Economie Rurale (CER) de
Marloie.
Partenaire n˚2 : Edwin, DE PAUW, Laboratoire de Spectrométrie de Masse, Université de Liège
Parrain n˚1 : Eppendorf Array Technologie SA (EAT), Prof. José REMARCLE
Résumé
Les infections nosocomiales sont reconnues comme des problèmes majeurs
de santé publique de par leur fréquence, leur coût, leur gravité. Le risque
de contracter une infection suite à une hospitalisation est de 5 à 9 % , ce
chiffre varie en fonction du service dans lequel la personne hospitalisée se
trouve. Les services les plus touchés sont les services de soins intensifs, la
néonatologie et les services de chirurgie.
Les infections nosocomiales les plus fréquemment responsables d’une issue
fatale sont les pneumopathies, les bactériémies (mortelles dans 20 % à
30 % des cas), les chocs septiques, les infections digestives et les infections
du site opératoire. Outre les décès, les infections nosocomiales sont la cause
de séquelles souvent considérables à moyen et long termes, notamment au
niveau fonctionnel. Les conséquences sont à la fois dommageables, et parfois
dramatiques, du point de vue de l’état sanitaire du patient, et financièrement
sensibles du point de vue du coût pour la société. Pour la Belgique,
le coût financier est estimé à 250 millions d’euros par an.
Les infections nosocomiales entraînent un surcoût financier important, essentiellement
dû à un allongement de la durée d’hospitalisation, au traitement
anti-infectieux et aux examens de laboratoire nécessaires au diagnostic
et à la surveillance de l’infection. On estime ainsi que la survenance
d’une infection allonge le séjour en chirurgie orthopédique de près de deux
semaines et augmente les coûts de prise en charge du patient de 300 % .
Parmi les agents responsables d’infections nosocomiales, les bactéries
viennent en tête et varie selon les sites d’infections. Staphylococcus est
surtout retrouvé dans les infections nosocomiales sur cathéter, les pneumonies,
et dans les infections du site opératoire. Escherichia coli est le germe
de l’infection urinaire, il est retrouvé dans les bactériémies. Pseudomonas
aeruginusa est responsable de nombreuses pneumonies.
Le genre Staphylococcus regroupe 43 espèces et sous-espèces, dont 17 ont
été retrouvées chez l’homme. La plupart de ces espèces sont des pathogènes
opportunistes chez l’homme présentant un risque élevé en cas de blessure
cutanée par un traumatisme ou par implantation directe d’un produit médical.
Parmi les staphylocoques, S. aureus est incontestablement l’espèce la
plus virulente, puisqu’elle produit un nombre important de toxines et d’enzymes
extracellulaires. Elle peut être à l’origine de pathologie nombreuses
et variées, allant du simple panaris, jusqu’aux infections les plus sévères
comme les septicémies, endocardites, pneumopathie, infections ostéoarticulaires,
dont le pronostic peut être très réservé. Il y a donc un grand intérêt
de détecter la présence de cette bactérie pathogène, de plus en plus impliquée
dans les maladies nosocomiales.
Les méthodes actuelles de diagnostic des infections staphylococciques au
laboratoire reposent sur deux approches. La première approche consiste en
un diagnostic indirect d’infection staphylococcique par la recherche des anticorps
circulants (endocardites, septicémies, infections osteo-articulaires).
La deuxième approche repose sur la recherche de la coagulase libre, la
DNase thermostables caractéristiques de l’espèce S. aureus et l’identification
moléculaire basée sur des PCR multiplex et le séquençage du gène
sodA.
Les techniques actuelles manquent de spécificité et sont globalement peu
sensibles et ne donnent pas d’informations sur les différents facteurs de virulence
associés à la souche. Il y a une faible corrélation entre le génotype
et le phénotype. Le génotypage des souches à lui seul n’est pas suffisant
pour l’identification des souches.
C’est pourquoi une différenciation rapide et spécifique des souches de staphylocoques
s’avère indispensable au diagnostic et aux choix thérapeutique.
L’objectif du projet est de développer une plate-forme "Antibodyarrays"
qui permet simultanément l’identification de différentes espèces de
staphylocoques et d’aider le clinicien dans le choix d’une antibiothérapie
adéquate.
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