Waleo 3 : Déclarations d'intention (PDF) - Recherche et Technologie

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Waleo 3 Déclarations d’intention Acronyme : RAIDGBS Titre : Développement d’un test pour l’identification rapide et facile de la colonisation vaginale par des streptocoques du groupe B Durée : 48 mois Promoteur : Bernard Joris, Université de Liège Coord. scient. : Bernard Joris (+32 478 612695) Partenaire n˚1 : Bernard Joris Centre d’Ingénierie des Protéines Université de Liège Partenaire n˚2 : Pierrette Melin Microbiologie médicale et virologie médicale Université de Liège Partenaire n˚3 : Edwin De Pauw Laboratoire de Spectrométrie de masse Université de Liège Partenaire n˚4 : Robert Brasseur Centre de Biophysique Moléculaire Numérique Faculté Universitaire des Sciences Agronomiques de Gembloux Parrain n˚1 : Coris BioConcept Science Park CREALYS Rue Jean Sonet 4A 5032 Gembloux Résumé Le streptocoque du groupe B (SGB) ou Streptococcus agalactiae est une des bactéries les plus fréquemment en cause dans les infections graves du nouveau-né et constitue un problème de santé publique, en raison du risque de décès foudroyant et des possible séquelles neurologiques ou pulmonaires. L’origine de ces infections néonatales est dans la très grande majorité des cas le portage vaginal maternel au terme de la grossesse, au moment de l’accouchement. Il faut savoir que ce portage est dynamique et peut varier au cours de la grossesse. Malgré les progrès thérapeutiques, ces infections néonatales restent associées à une morbidité et une mortalité importantes. En Belgique, en dépit d’une stratégie de prévention basée sur un dépistage prénatal et l’administration d’antibiotique intrapartum, en intra-veineux, aux femmes SGB-positives, 100 à 200 nouveau-nés présentent encore chaque année une infection grave à SGB et plus de 10 % en meurent. La plupart de ces infections pourraient être prévenues par un dépistage intrapartum par une détection rapide et en temps réel du risque pour le nouveau-né, sur un prélèvement génital de la femme admise pour accoucher. De plus, l’utilisation de ce type de test permettrait de réduire le nombre d’antibioprophylaxie inutile. A ce jour, aucun test commercial " abordable financièrement "ne présente la faisabilité, la rapidité, la sensibilité et la spécificité requises pour prévenir la septicémie néonatale. L’objectif de ce projet est de mettre en évidence les protéines présentes à la surface des SGB et qui pourraient être utilisées pour développer un test de détection. Cet " inventaire protéique " sera réalisé par des approches originales combinant la bioinformatique, la chromatographie à deux dimensions ou plus, la chromatographie d’affinité et la spectrométrie de masse. Les protéines les plus intéressantes seront clonées et purifiées afin de réaliser des anticorps dirigés contre elles et de vérifier leur utilité pour l’identification des SGB. RAIDGBS (174) Page 50/66 (. . . )
Waleo 3 Déclarations d’intention Acronyme : RAPARRAY Titre : Réalisation d’un damier de peptides aléatoires avec une détection intrinsèque des interactions protéines-peptides. Durée : 48 mois Promoteur : Bernard Joris, Université de Liège Coord. scient. : Bernard Joris (+32 478 612695) Partenaire n˚1 : Bernard Joris Centre d’Ingénierie des Protéines Université de Liège Partenaire n˚2 : Jacqueline Marchand Unité de chimie organique et médicinale Université Catholique de Louvain Partenaire n˚3 : Paul Thiry Laboratoire lasers et spectroscopies Facultés Universitaires Notre-de la Paix Namur Partenaire n˚4 : Sophie Demoustier Unité de chimie et de physique des hauts polymères Université Catholique de Louvain Parrain n˚1 : Euroscan Instruments SA Rue de la Sitree 13 5020 Vedrin Belgium Parrain n˚2 : Discussions en cours Résumé Les interactions des macromolécules biologiques entre elles et/ou avec des ligands sont d’une importance cruciale pour le bon déroulement du cycle cellulaire. Un dysfonctionnement de ces interactions conduit le plus souvent à l’apparition d’une pathologie. La mise en évidence de la modification de ces interactions permet d’établir un diagnostique tandis que le médicament, le plus souvent, un petit ligand, permet de corriger ces dysfonctionnements. Parmi les outils de la biologie moléculaire, la technique du " phage display " (banque aléatoire de peptides présentés à la surface d’un bactériophage) va été utilisée pour mettre en évidence des interactions protéineprotéine, obtenir des mini anticorps spécifiques et sélectionner des peptides (inhibiteur, activateur, . . . ) interagissant avec une protéine d’intérêt (récep- teur cellulaire, enzyme,. . . ). Dans ce dernier cas, le peptide sélectionné à partir d’une banque aléatoire est ensuite utilisé pour réaliser une molécule organique mimant la structure de ce peptide (peptidomimétisme). Le projet proposé a pour objectif de créer un damier de peptides aléatoires présentés sur une protéine porteuse originale fixée sur des nanoparticules fonctionnalisées et une détection intrinsèque de l’interaction peptideprotéine d’intérêt. Le programme proposé est en ligne directe avec le programme OPARRAY. Il reprend à l’heure actuelle les partenaires du programme OPARRAY plus deux nouveaux partenaires, l’un spécialisé dans les nanostructures et l’autre directement impliqué dans l’étude d’une maladie. RAPARRAY (175) Page 51/66
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