rapport d'auto-Žvaluation - Ecologie & Evolution - Université Pierre ...

l’importance du processus de mutation des marqueurs sur l’estimation de la diversité génétique. En
collaboration avec l’équipe de Hugues Roest-Crollius (IBENS), nous avons développé de nouvelles
méthodes (scans génomiques) permettant d’identifier des signaux de sélection positive à différentes
échelles évolutives chez différentes espèces de primates. Les gènes ainsi identifiés représentent des
"points chauds" de sélection positive, et leur étude permet de mieux cerner les gènes sélectionnés
spécifiquement au cours de l’évolution humaine. [28, 61, 64, 97]
D. Axes de recherche collaboratifs inter-equipes
Plusieurs projets inter-équipes (voir section suivante) ont aussi fortement contribué aux
applications empiriques des travaux théoriques d’EEM.
Variation phénotypique individuelle et dynamique des populations. En collaboration avec
l’équipe Changements Globaux et Processus Adaptatifs, nous poursuivons le développement de la
modélisation des populations physiologiquement structurées que nous appliquons notamment aux
organismes étudiés par l’équipe CGPA (collembole Folsomia candida, lézard vivipare, vipère d’Orsini).
Ces travaux nous permettent de prédire comment les fluctuations de l’environnement (ressources,
température) affectent la stratégie d’allocation des ressources aux traits biodémographiques (survie,
croissance, reproduction), et comment elles se traduisent au niveau de la population, sur sa
régulation, sa structure et sa dynamique temporelle (thèses de V. Le Bourlot et F. Mallard ; ANR
« EVORANGE » ; collaboration avec H. Kokko et K. Norris). [2, 8, 9, 18, 35, 36, 38, 63 , 77, 78, 84, 85,
93, 99, 105, 106, 108, 110, 111, 112, 114]
Gradients environnementaux et diversité des traits d’histoire de vie. En collaboration
avec l’équipe Evolution des Sociétés Animales, nous avons analysé les mécanismes responsables de
la variation de la stratégie de reproduction chez une fourmi coloniale distribuée sur un gradient
latitudinal (tropical-tempéré). En associant l’analyse des données à un modèle de dynamique de
population, nous avons montré que le pattern de variation observée le long du gradient s’accordait
avec les prédictions obtenues en supposant l’évolution adaptative de la stratégie de reproduction
sous la contrainte d’un trade-off fondamental (entre qualité et quantité des descendants). Ces
résultats illustrent la portée de la modélisation éco-évolutive pour explorer le rôle de facteurs
adaptatifs dans la variation phénotypique le long de gradients environnementaux. [113]
Modèle empirique d’endosymbiose. En collaboration avec l’équipe Ecophysiologie
Evolutive nous avons initié le développement d’un modèle d’étude des impacts évolutifs et
écologiques des micro-organismes commensaux (bactéries) sur la flore intestinale d’hôtes (Blatella
germanica et Eublaberus distenti). Ce système nous permettra de développer l’interface empirique
des modèles éco-évolutifs d’endosymbiose que nous avons commencé d’analyser pendant la période
contractuelle écoulée.
3 – Rayonnement et attractivité académiques
114 articles ont été publiés par les membres de l’équipe dans des revues internationales référencés
durant la période contractuelle écoulée ; 70 articles, soit près des deux tiers de la production d’EEM,
sont parus dans des revues de facteur d’impact supérieur à 4. Les quatre h-index les plus élevés sont
de 24 (Regis Ferriere), 19 (Bernard Cazelles), 17 (Minus van Baalen) et 16 (Tom Van Dooren).
L’équipe compte plusieurs éditeurs associés pour des revues importantes : Ecology Letters ;
Evolution ; Proceedings of the Royal Society London B ; Journal of Evolutionary Biology ;
Evolutionary Ecology ; Animal Biology ; Infectious Diseases: Research and Treatment ; Chaos,
Solitons & Fractals. Les membres de l’équipe sont fréquemment sollicités pour l’expertise de
manuscrits soumis aux journaux de haut rang international tels que Nature, Science, Ecology Letters,
PloS Computational Biology, Proceedings of the National Academy of Sciences USA, Proceedings of
the Royal Society B, American Naturalist.
L’interdisciplinarité de l’équipe est inscrite dans son intitulé même. Elle s’est traduite au cours de la
période écoulée par (1) un riche ensemble de collaborations scientifiques avec plus de 40
partenaires académiques ; (2) quatre thèses avec co-encadrements extérieur à l’équipe; (3)
l’accueil de visiteurs de haut niveau, dont 2 professeurs en séjour sabbatique.
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