16.09.2013 Views

Cancer med okänd primaritet - Regionalt cancercentrum syd

Cancer med okänd primaritet - Regionalt cancercentrum syd

Cancer med okänd primaritet - Regionalt cancercentrum syd

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

16<br />

Ordonez NG. The immunohistochemical diagnosis of mesothelioma: a comparative study of epithelioid<br />

mesothelioma and lung adenocarcinoma. Am J Surg Pathol 2003;27:1031-51<br />

Genetisk och molekylärbiologisk diagnostik<br />

Genetisk diagnostik<br />

Gisela Barbany Bustinza<br />

Solida tumörer uppvisar ofta cytogenetiska avvikelser, som kan vara mycket komplexa <strong>med</strong><br />

multipla kloner och subkloner. Kunskapen om avvikelserna är dock begränsad, eftersom<br />

tumörceller är svårodlade. För att kringgå problemet kan man försöka påvisa specifika<br />

förändringar <strong>med</strong> FISH- (fluorescence in situ hybridization) analys. FISH kan göras på<br />

imprintpreparat, cytospinpreparat från fin- och mellannålsbiopsier och på paraffinsnitt.<br />

Till skillnad från vid hematopoetiska maligniteter har man hittills inte kunnat identifiera<br />

återkommande diagnos-specifika cytogenetiska förändringar, som kan vägleda vid tumörer<br />

<strong>med</strong> <strong>okänd</strong> primär lokalisation. Det går emellertid ofta att undersöka tumörer för deletioner<br />

som är överrepresenterade vid vissa tumörer. Exempelvis saknas det material från<br />

kromosomarm 3p i över 90 % av lungcancrar, och 50 % av <strong>med</strong>ulloblastom har en<br />

isokromosom 17q. Isokromosom 12p ses ofta i germinalcellstumörer och en sådan eller en<br />

deletion i 12p anges förekomma också i en fjärdedel av lågt differentierade huvudsakligen<br />

körtelmetastaserande maligniteter <strong>med</strong> <strong>okänd</strong> <strong>primaritet</strong> (Pavlidis 2009). För aktuell<br />

information om analyser och materialbehov hänvisas till enheterna för klinisk genetik,<br />

alternativt molekylär patologi, i respektive region.<br />

En nytillkommen metod för att påvisa gendosvariationer i tumörceller, deletioner eller<br />

duplikationer, är SNP- (single-nucleotide polymorphism) baserad array-CGH (comparative<br />

genomic hybridization) som också kan identifiera regioner <strong>med</strong> ”copy-neutral loss of<br />

heterozygosity”. Fördelen <strong>med</strong> metoden är att den är en ”screening” som ger information om<br />

hela genomet till skillnad från FISH som är en riktad analys. Metoden är väletablerad för<br />

konstitutionella tillstånd, men får betraktas som experimentell för tumördiagnostik.<br />

Pavlidis N, Fizazi K. Carcinoma of unknown primary (CUP). Crit Rev Oncol Hematol. 2009;69:271-8. Epub<br />

2008 Nov 1<br />

Molekylärbiologisk diagnostik<br />

Peter Gunvén<br />

Förutom att analysera immunhistokemiskt och cytogenetiskt kan man undersöka tumörers<br />

genuttryck. En kommersiell test, CupPrint, utnyttjar formalinfixerade paraffinbäddade snitt<br />

vars RNA-mönster jämförs <strong>med</strong> motsvarande uttryck från cirka 600 kända tumörer av ett<br />

femtiotal typer. De fem närmast liggande alternativen anges, varvid samma tumörform kan<br />

förekomma upp till fem gånger. I retrospektiva analyser har man hävdat en träffsäkerhet över<br />

80 procent, och en prospektiv studie värderar nu metoden (Bridgewater 2008, Horlings 2008).<br />

Liknande analyser görs också av andra (Varadhachary 2008). Tills vidare ingår inte<br />

metoderna i rutinutredning.

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!