Jahresbericht 2003 - Leibniz Institute for Age Research
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Arbeitsgruppe Diekmann<br />
2. E. coli Systembiologie<br />
Mitarbeiter: C. Hoischen, B. Küntzel (Schwangerschaftsvertretung bis 31.10.<strong>2003</strong>),<br />
S. Pfeifer (seit 01.11.<strong>2003</strong> zurück aus Schwangerschaftsurlaub).<br />
Finanzierung: Haushalt-IMB<br />
Kooperationen: S. Addinall (Manchester), O. Holst (FZ Borstel), H.J. Krügel (HKI Jena)<br />
Jiang Xing-Mai (Singapur), Gerd Miksch (Universität Bielefeld)<br />
Gemeinsam mit den Arbeitsgruppen Platzer (Genomanalyse, R. Siddiqui) und Große<br />
(Biochemie, B. Schlott) arbeiteten wir an der vergleichenden genomischen und funktionellen<br />
Analyse der seit Jahren am IMB kultivierten zellwandlosen stabilen Protoplasten von<br />
Escherichia coli K12. R. Siddiqui führte die Sequenzierung der Organismen durch, während<br />
B. Schlott die Proteinmuster mittels 2D-Gelelektrophorese verglich. Wir untersuchten das<br />
Genexpressions-Muster mittels DNA Microarray Technologie (Kooperation mit H. Krügel,<br />
HKI). Zudem wurden in unserer Arbeitsgruppe die Zellen entsprechend der aus der genomischen<br />
Analyse gewonnenen Befunde biologisch und funktionell charakterisiert.<br />
Publikationen<br />
Referierte Publikationen<br />
Appel, T. R. & J. Makovitzky. Romhányi’s staining methods applied to tissue-isolated<br />
amyloid fibrils. Acta Histochemica 105 (<strong>2003</strong>) 371-372.<br />
Appel, T. R., N. Yehia, U. Baumeister, H. Hartung, R. Kluge, D. Ströhl & E. Fanghänel.<br />
Electrophilic Cyclisation of Bis(4-methoxybenzylthio)acetylene – Competition between Ar 2 -<br />
6 and Ar 1 -5 Routes, Yielding 1 H-2-Benzothiopyrans or Spiro Derivatives of<br />
Cyclohexadienone. Eur. J. Org. Chem. (<strong>2003</strong>) 47-53.<br />
Diekmann, S., G. Siegmund, A. Roecker & D.O. Klemm. Regioselective nitrilotriacetic<br />
acid-cellulose-nickel-complexes <strong>for</strong> immobilisation of His 6 -tag proteins. Cellulose 10<br />
(<strong>2003</strong>) 53-63.<br />
Fändrich, M., V. Forge, K. Buder, M. Kittler, C.M.Dobson & S. Diekmann. Myoglobin <strong>for</strong>ms<br />
amyloid fibrils by association of unfolded polypeptide segments. PNAS 100 (<strong>2003</strong>) 15463-<br />
15468.<br />
Hettmann, T., S. Anemüller, H. Borcherding, L. Mathé, P. Steinrücke & S. Diekmann.<br />
Pseudomonas stutzeri soluble nitrate reductase αβ-subunit is a soluble enzyme with a<br />
similar electronic structure at the active site as the inner membrane-bound αβγ<br />
holoenzyme. FEBS Letters 534 (<strong>2003</strong>) 143-150.<br />
Hettmann, T., R. Siddiqui, J. Langen, Ch. Frey, M. Romao, S. Diekmann. Mutagenesis study<br />
on the role of a lysine residue highly conserved in <strong>for</strong>mate dehydrogenases and<br />
periplasmic nitrate reductases. Biochem. Biophys. Res. Comm. 310 (<strong>2003</strong>) 40-47.<br />
Sauter, S. R., S. Diekmann & V. Braun. Two-step purification of the outer membrane<br />
transporter and activator protein Sh1B from Escherichia coli using internally His 6 -tagged<br />
constructs. Journal of Chromatography B 786 (<strong>2003</strong>) 33-37.<br />
Toshkova, R., E. Ivanova, S. Toshkov & C. Hoischen. Inhibition of tumor development by<br />
Proteus mirabilis VI stable L-<strong>for</strong>m cytoplasmic membranes. Experimental Oncology 25<br />
(<strong>2003</strong>) 124-127.<br />
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