Jahresbericht 2003 - Leibniz Institute for Age Research
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Arbeitsgruppe Sühnel<br />
Arbeitsgruppe Sühnel<br />
Biocomputing<br />
Jürgen Sühnel<br />
Dr. sc. nat., Friedrich-Schiller-Universität Jena (1987)<br />
Dr. rer. nat., Technische Universität Dresden (1975)<br />
Wissenschaftler<br />
Dipl.-Inf. Friedrich Haubensak 1)<br />
Dr. Gerhard Müller 1)<br />
Dr. Kerstin Rahn 2)<br />
Dipl.-Biol. Jan Reichert 1,2)<br />
Dr. Eberhard Schmitt 1)<br />
Dr. Alessandro Romualdi 2)<br />
Dr. Andrzej Szymoszek 2)<br />
Dr. Karin Wieligmann 3)<br />
(ehemals Theoretische Biophysik)<br />
(ehemals Theoretische Biophysik)<br />
Wissenschaftlich-technische Mitarbeiter<br />
Dipl.-Ing. Herbert Liebisch 1)<br />
Kristina Mehliß 1) , Math.-technische Assistentin<br />
Doktoranden<br />
Gilberto Villescas-Diaz 1)<br />
Nico Riemann 2)<br />
(ehemals Theoretische Biophysik)<br />
(ehemals Theoretische Biophysik)<br />
Praktikanten<br />
Michal Baum, Bioin<strong>for</strong>matikstudent an der FSU Jena (Wiss. Hilfskraft)<br />
Daniela Albrecht<br />
Nadja Klujewa<br />
Finanzierung<br />
1) Haushalt des IMB<br />
2)<br />
BMBF-Projekt 0312704E (JCB)<br />
3) DFG SFB 604 (von M. Zacharias eingeworben)<br />
Überblick<br />
Die Arbeitsgruppe arbeitet vorwiegend in den Bereichen Bioin<strong>for</strong>matik/Computational<br />
Biology. Hier haben wir uns insbesondere für die Identifikation und Analyse bisher unbekannter<br />
oder ungewöhnlicher Strukturmotive interessiert. Die Motivation für diese Arbeiten<br />
ergibt sich aus der Tatsache, dass trotz einer schnell größer werdenden Datenbasis von<br />
experimentellen dreidimensionalen (3D) Strukturen erfolgreiche Vorhersagen der 3D-Strukturen<br />
biologischer Makromoleküle nach wie vor eher die Ausnahme als die Regel sind. Eine<br />
mögliche Erklärung ist, dass unser bisheriges Wissen in diesem Bereich unvollständig ist.<br />
Im Jahre <strong>2003</strong> haben wir eine Reihe von Resultaten zu Basentetraden in Nukleinsäuren, die<br />
z.B. in Telomerenstrukturen vorkommen, in Publikationen beschrieben. Daneben haben wir<br />
an einer Analyse zur Rolle von sogenannten nicht-repetitiven Dipeptiden in Proteinen weitergearbeitet.<br />
Unsere Datenbank, die IMB Jena Image Library of Biological Macromolecules<br />
(http://www.imb-jena.de/IMAGE.html), die ausgehend von Daten aus der Proteindatenbank<br />
In<strong>for</strong>mationen zu allen gegenwärtig bekannten dreidimensionalen Biopolymerstrukturen anbietet,<br />
wurde substantiell weiterentwickelt. In einem Gemeinschaftsprojekt mit dem Hans-<br />
Knöll-Institut für Naturstoff-Forschung und mit zwei Arbeitsgruppen von der Friedrich-<br />
Schiller-Universität wurde die Struktur des antibiotisch wirkenden Peptaibols Ampullosporin<br />
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