Arbeitsgruppe Diekmann 2. E. coli Systembiologie Mitarbeiter: C. Hoischen, B. Küntzel (Schwangerschaftsvertretung bis 31.10.<strong>2003</strong>), S. Pfeifer (seit 01.11.<strong>2003</strong> zurück aus Schwangerschaftsurlaub). Finanzierung: Haushalt-IMB Kooperationen: S. Addinall (Manchester), O. Holst (FZ Borstel), H.J. Krügel (HKI Jena) Jiang Xing-Mai (Singapur), Gerd Miksch (Universität Bielefeld) Gemeinsam mit den Arbeitsgruppen Platzer (Genomanalyse, R. Siddiqui) und Große (Biochemie, B. Schlott) arbeiteten wir an der vergleichenden genomischen und funktionellen Analyse der seit Jahren am IMB kultivierten zellwandlosen stabilen Protoplasten von Escherichia coli K12. R. Siddiqui führte die Sequenzierung der Organismen durch, während B. Schlott die Proteinmuster mittels 2D-Gelelektrophorese verglich. Wir untersuchten das Genexpressions-Muster mittels DNA Microarray Technologie (Kooperation mit H. Krügel, HKI). Zudem wurden in unserer Arbeitsgruppe die Zellen entsprechend der aus der genomischen Analyse gewonnenen Befunde biologisch und funktionell charakterisiert. Publikationen Referierte Publikationen Appel, T. R. & J. Makovitzky. Romhányi’s staining methods applied to tissue-isolated amyloid fibrils. Acta Histochemica 105 (<strong>2003</strong>) 371-372. Appel, T. R., N. Yehia, U. Baumeister, H. Hartung, R. Kluge, D. Ströhl & E. Fanghänel. Electrophilic Cyclisation of Bis(4-methoxybenzylthio)acetylene – Competition between Ar 2 - 6 and Ar 1 -5 Routes, Yielding 1 H-2-Benzothiopyrans or Spiro Derivatives of Cyclohexadienone. Eur. J. Org. Chem. (<strong>2003</strong>) 47-53. Diekmann, S., G. Siegmund, A. Roecker & D.O. Klemm. Regioselective nitrilotriacetic acid-cellulose-nickel-complexes <strong>for</strong> immobilisation of His 6 -tag proteins. Cellulose 10 (<strong>2003</strong>) 53-63. Fändrich, M., V. Forge, K. Buder, M. Kittler, C.M.Dobson & S. Diekmann. Myoglobin <strong>for</strong>ms amyloid fibrils by association of unfolded polypeptide segments. PNAS 100 (<strong>2003</strong>) 15463- 15468. Hettmann, T., S. Anemüller, H. Borcherding, L. Mathé, P. Steinrücke & S. Diekmann. Pseudomonas stutzeri soluble nitrate reductase αβ-subunit is a soluble enzyme with a similar electronic structure at the active site as the inner membrane-bound αβγ holoenzyme. FEBS Letters 534 (<strong>2003</strong>) 143-150. Hettmann, T., R. Siddiqui, J. Langen, Ch. Frey, M. Romao, S. Diekmann. Mutagenesis study on the role of a lysine residue highly conserved in <strong>for</strong>mate dehydrogenases and periplasmic nitrate reductases. Biochem. Biophys. Res. Comm. 310 (<strong>2003</strong>) 40-47. Sauter, S. R., S. Diekmann & V. Braun. Two-step purification of the outer membrane transporter and activator protein Sh1B from Escherichia coli using internally His 6 -tagged constructs. Journal of Chromatography B 786 (<strong>2003</strong>) 33-37. Toshkova, R., E. Ivanova, S. Toshkov & C. Hoischen. Inhibition of tumor development by Proteus mirabilis VI stable L-<strong>for</strong>m cytoplasmic membranes. Experimental Oncology 25 (<strong>2003</strong>) 124-127. 14
Arbeitsgruppe Diekmann Nicht referierte Publikationen Appel, T.R., G. Gellermann, C. Leisner, T. Lütkepohl, J. Raskatov & J. Rossa. Dünnschichtchromatographische Analyse von Lipiden. GIT Laborfachzeitschrift (<strong>2003</strong>) in press. Hemmerich, P. & S. Diekmann (editors) Visions of the Cell Nucleus, American Scientific Publishers, CA, USA in press. 15
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