Jahresbericht 2003 - Leibniz Institute for Age Research
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Arbeitsgruppe Sühnel<br />
8. Geometrie von Nucleus-Strukturen<br />
Mitarbeiter:<br />
E. Schmitt<br />
Finanzierung: Haushalt IMB<br />
Kooperation - intern: IMB-Gruppe Molekularbiologie<br />
Für die Beschreibung geometrischer Verhältnisse verschiedener Nukleusstrukturen (PML-<br />
Bodies, Genlokationen) zueinander wurde ein mathematisches Modell entwickelt, das die<br />
statistische Interpretation der Signifikanz experimenteller Messungen erlaubt. In seiner Allgemeinheit<br />
ist das Modell auch zur Beschreibung signifikanter Unterschiede bei der Agglomeration<br />
von Proteinen geeignet.<br />
9. RNA World Website<br />
Mitarbeiter:<br />
J. Sühnel<br />
Finanzierung: Haushalt IMB<br />
Die RNA World Website ist eine 1995 gestartete Internet-Ressource (http://www.imb-jena.de/<br />
RNA.html), deren Ziel darin besteht, möglichst viele In<strong>for</strong>mationsquellen mit Relevanz für die<br />
RNA-Forschung zu sammeln. Sie war die erste und ist nach unserem Kenntnisstand nach<br />
wie vor die umfassendste Internet-Ressource im Bereich der RNA-Forschung. Sie wurde<br />
<strong>2003</strong> erneut sehr positiv besprochen (C. Hammann, ChemBioChem <strong>2003</strong>, 4, 1103: RNA <strong>for</strong><br />
everyone: The IMB Jena RNA World Website). Das Ausmaß ihrer Nutzung zeigt sich auch<br />
darin, dass die Website bei Google unter dem Stichwort ‚RNA’ an zweiter Stelle rangiert.<br />
Publikationen<br />
Referierte Publikationen<br />
Hausmann, M., R. Winkler, G. Hildenbrand, J. Finsterle, A. Weisel, A. Rapp, E. Schmitt,<br />
S. Janz & C. Cremer. COMBO_FISH: Specific labeling of nondenaturated chromatin<br />
targets by computer-selected DNA oligonucleotide probe communications. BioTechniques<br />
35 (<strong>2003</strong>) 564-577.<br />
Kronen, M., H. Görls, H.-H. Nguyen, S. Reißmann, M. Bohl, J. Sühnel & U. Gräfe. Crystal<br />
structure and con<strong>for</strong>mational analysis of ampullosporin A. J.Peptide Sci. 9 (<strong>2003</strong>) 729-744.<br />
Louit, G., A. Hoquet, M. Ghomi, M. Meyer & J. Sühnel. Guanine tetrads interacting with metal<br />
ions. An AIM topological analysis of the electron density. PhysChemComm 6 (<strong>2003</strong>) 1-5.<br />
Meyer, M. & J. Sühnel. Self-association of isoguanine nucleobases and molecular recognition<br />
of alkaline ions: tetrad versus pentad structures. J. Phys. Chem. A 107 (<strong>2003</strong>)1025-1031.<br />
Meyer, M. & J. Sühnel. Interaction of cyclic cytosine-, guanine-, thymine-, uracil- and mixed<br />
guanine-cytosine base tetrads with K+, Na+ and Li+ ions - a density functional study. J.<br />
Biomol. Struct. Dyn. 20 (<strong>2003</strong>) 507-518.<br />
Nicht referierte Publikationen<br />
Meyer, M. & J. Sühnel. Berichte des Interdisziplinären Zentrums für Wissenschaftliches<br />
Rechnen (Friedrich-Schiller-Universität Jena), Band 2, <strong>2003</strong>, 43-60. Computational<br />
Studies on Base Tetrad Motifs in Nucleic Acid Structures - Quantum Chemistry Helps to<br />
Understand Biology.<br />
Buchbeitrag<br />
Meyer, M. & J. Sühnel. Base polyad motifs in nucleic acids - biological significance,<br />
occurrence in three-dimensional experimental structures and computational studies. In:<br />
Computational Chemistry: Reviews of Current Trends, Vol. 8, J. Leszczynski (Ed.),<br />
World Scientific Publishing Co., Singapore (ISBN 981-238-702-1), (<strong>2003</strong>) 161-208.<br />
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