Jahresbericht 2003 - Leibniz Institute for Age Research

Arbeitsgruppe Sühnel
aufgeklärt, eine neue Methode zur quantitativen Bestimmung der Krümmung von Peptiden
vorgeschlagen und eine Computeranalyse des Konformationsraumes des Ampullosporins
durchgeführt. Schließlich haben wir in einem Projekt mit der Arbeitsgruppe Platzer
(Genomanalyse) ein Annotations- und Genomanalysesystem mit einem Schwerpunkt auf
niedrig-redundanter Sequenzierung und Genomvergleichen entwickelt.
Ein Nebenprodukt unserer Arbeiten sind zwei weltweit intensiv genutzte Websites, die RNA
World Website (http://www.imb-jena.de/RNA.html) und die JCB Protein-Protein Interaction
Website (http://www.imb-jena.de/jcb/ppi).
Das 2001 gegründete Jenaer Centrum für Bioinformatik – JCB wird von der Arbeitsgruppe
Sühnel (Biocomputing) koordiniert. Die Gruppe ist auch verantwortlich für den Betrieb des
Instituts-Computernetzes einschließlich der Internetanbindung.
Mitarbeiter der von M. Zacharias geleiteten Arbeitsgruppe Theoretische Biophysik (N.
Riemann, Andrzej Szymoszek, Villescas-Diaz) wurden nach seinem Weggang im Januar
2003 in die Arbeitsgruppe Sühnel integriert. Die fachliche Betreuung wurde weiterhin von M.
Zacharias geleistet. Die Beschreibung der wissenschaftlichen Resultate ist in dem Bericht
der Arbeitsgruppe Zacharias (Theoretische Biophysik) zu finden.
Das Jenaer Centrum für Bioinformatik – JCB
Mitarbeiter:
J. Sühnel (Centrums-Koordinator)
Finanzierung: IMB-Anteil des JCB-Projektes durch das BMBF-Projekt 0312704E
Kooperationen-intern: Arbeitsgruppen Zacharias, Wilhelm, Platzer, Görlach
Kooperationen-extern: Friedrich-Schiller-Universität (AG’s der Fakultäten für Medizin, Biologie und
Pharmazie bzw. Mathematik und Informatik), Fachhochschule Jena, Hans-
Knöll-Institut für Naturstoff-Forschung, Max-Planck-Institut für Chemische
Ökologie, Clondiag Chip Technologies GmbH, BioControl Jena GmbH,
Jenapharm GmbH & Co. KG
CUBIC – Cologne University Bioinformatics Center,
Intergenomics- Braunschweig Bioinformatics Competence Center,
BCB – Berlin Center for Genome Based Bioinformatics
BFAM – Bioinformatics for the Functional Analysis of Mammalian Gednomes
(Munic)
BIC–GH – Bioinformatics Center Gatersleben- Halle
IZBI – Interdisciplinary Center for Bioinformatics, Leipzig
Im Jahr 2001 ist es unter Beteiligung mehrerer Jenaer Arbeitsgruppen und Firmen im Rahmen
der Ausbildungs- und Technologie-Initiative Bioinformatik des BMBF gelungen, eine insgesamt
5-jährige Förderung für den Aufbau eines Kompetenz-Zentrums in Bioinformatik in
Jena zu erhalten. Das Jenaer Centrum für Bioinformatik (JCB) hat das Ziel, die vorhandene
Expertise in den Bereichen Bioinformatik und Computational Biology im Hinblick auf Ausbildung,
Forschung und Entwicklung zu vernetzen und zu erweitern. Zusätzlich zum existierenden
Studiengang Bioinformatik werden kurzfristig wirkende Ausbildungsaktivitäten etabliert.
Durch die Einrichtung dreier Nachwuchsgruppen, eine davon am IMB, sollten bisher
nicht vorhandene Forschungsfelder nach Jena geholt werden. Am IMB wurde auf diesem
Wege die Arbeitsgruppe Wilhelm (Theoretische Systembiologie) eingerichtet. Schließlich
integrieren Forschungsverbundprojekte Know-how aus Arbeitsgruppen und Firmen. Der
wissenschaftliche Fokus des JCB ist auf Molekulare Kommunikationsprozesse in normalen
und pathologischen Zuständen von Zellen gerichtet. JCB-Mitglieder sind gegenwärtig die
FSU Jena (Fakultäten für Biologie und Pharmazie, Mathematik und Informatik, Medizin), die
FH Jena, das MPI für Chemische Ökologie, das HKI, das IMB, Biocontrol Jena GmbH,
Clondiag Chip Technologies GmbH und Jenapharm GmbH & Co. KG. Das JCB hat enge
Kontakte zu den Interdisziplinären Zentren für Wissenschaftliches Rechnen und für Klinische
Forschung und zu dem Sonderforschungsbereich „Multifunktionelle Signalproteine.“ Das JCB
spielt eine nicht unerhebliche Rolle bei der Vernetzung der vorhandenen Expertise auf dem
Beutenberg-Campus und in Jena insgesamt.
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