20.03.2023 Views

Revista Newslab Edição 176

Revista Newslab Edição 176 - Março 2023

Revista Newslab Edição 176 - Março 2023

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

MEDICINA GENÔMICA<br />

especialmente para identificar se os<br />

ambientes urbanos possuem algum<br />

perfil específico de microbiota.<br />

Inicialmente, o estudo identificou<br />

cerca de 4 mil espécies conhecidas<br />

de microrganismos de áreas<br />

urbanas. Destes, identificaram um<br />

conjunto comum de 31 espécies<br />

de microrganismos em 97% das<br />

amostras analisadas.<br />

No entanto, os resultados de<br />

distribuição mostraram que cada<br />

cidade tem seu perfil molecular de<br />

microrganismos, como uma assinatura<br />

microbiana, que é impulsionada pela<br />

localização geográfica e climática.<br />

O estudo também identificou cerca<br />

de 11 mil vírus, 1300 bactérias, 2<br />

Archaea e mais de 800 mil sequências<br />

CRISPr que não foram encontradas em<br />

bancos de dados de referência.<br />

Quanto ao perfil de resistência a<br />

antimicrobianos, os pesquisadores<br />

identificaram sequencias de genes<br />

AMR, no entanto não necessariamente<br />

de forma abundante.<br />

Na Oceania e no Oriente Médio,<br />

por exemplo, a análise identificou<br />

genes ARM com menor quantidade<br />

em relação a outros continentes.<br />

Isso pode ser resultado de perfis de<br />

utilização de antimicrobianos ou<br />

pela própria diferença de geografia<br />

urbana entre as cidades.<br />

Por fim, o consórcio desenvolveu um<br />

conjunto de ferramentas para acessar<br />

e analisar o atlas do estudo global de<br />

metagenômica urbana.<br />

As ferramentas oferecem<br />

visualizações interativas dos<br />

resultados do estudo, os pipelines e<br />

figuras analíticas, entre outros. Todos<br />

os detalhes do estudo global e de<br />

outros realizados pelo grupo estão<br />

disponíveis no site metasub.org<br />

Referências<br />

Danko, David et al. “A global metagenomic map of urban<br />

microbiomes and antimicrobial resistance.” Cell, S0092-<br />

8674(21)00585-7. 2021, doi:10.1016/j.cell.2021.05.002<br />

Dulanto Chiang A, Dekker JP. From the Pipeline to the Bedside:<br />

Advances and Challenges in Clinical Metagenomics. J Infect<br />

Dis. 2020 ;221(Suppl 3):S331-S340. doi: 10.1093/infdis/jiz151.<br />

PMID: 31538184; PMCID: PMC7325616.<br />

Fadiji AE, Babalola OO. Metagenomics methods for the<br />

study of plant-associated microbial communities: A review.<br />

J Microbiol Methods. 2020 ;170:105860. doi: 10.1016/j.<br />

mimet.2020.105860. Epub 2020 Feb 4. PMID: 32027927.<br />

Laudadio I, Fulci V, Stronati L, Carissimi C. Next-Generation<br />

Metagenomics: Methodological Challenges and<br />

Opportunities. OMICS. 2019; 23(7):327-333. doi: 10.1089/<br />

omi.2019.0073. Epub 2019 Jun 12. PMID: 31188063.<br />

Wei, Fuwen et al. “Conservation metagenomics: a new branch<br />

of conservation biology.” Science China. Life sciences vol. 62,2.<br />

2019: 168-178. doi:10.1007/s11427-018-9423-3<br />

FONTE:<br />

Varsomics<br />

União de soluções tecnológicas para a prática da medicina de precisão. Nossa missão é ser referência de excelência no desenvolvimento de soluções<br />

de bioinformática e prestação de serviços aplicados na área de diagnóstico clínico e de pesquisas acadêmicas, para auxiliar a comunidade científica a<br />

difundir cada vez mais o conhecimento.<br />

114 <strong>Revista</strong> NewsLab <strong>Edição</strong> <strong>176</strong> | Março 2023

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!