Revista Newslab Edição 176
Revista Newslab Edição 176 - Março 2023
Revista Newslab Edição 176 - Março 2023
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
MEDICINA GENÔMICA<br />
especialmente para identificar se os<br />
ambientes urbanos possuem algum<br />
perfil específico de microbiota.<br />
Inicialmente, o estudo identificou<br />
cerca de 4 mil espécies conhecidas<br />
de microrganismos de áreas<br />
urbanas. Destes, identificaram um<br />
conjunto comum de 31 espécies<br />
de microrganismos em 97% das<br />
amostras analisadas.<br />
No entanto, os resultados de<br />
distribuição mostraram que cada<br />
cidade tem seu perfil molecular de<br />
microrganismos, como uma assinatura<br />
microbiana, que é impulsionada pela<br />
localização geográfica e climática.<br />
O estudo também identificou cerca<br />
de 11 mil vírus, 1300 bactérias, 2<br />
Archaea e mais de 800 mil sequências<br />
CRISPr que não foram encontradas em<br />
bancos de dados de referência.<br />
Quanto ao perfil de resistência a<br />
antimicrobianos, os pesquisadores<br />
identificaram sequencias de genes<br />
AMR, no entanto não necessariamente<br />
de forma abundante.<br />
Na Oceania e no Oriente Médio,<br />
por exemplo, a análise identificou<br />
genes ARM com menor quantidade<br />
em relação a outros continentes.<br />
Isso pode ser resultado de perfis de<br />
utilização de antimicrobianos ou<br />
pela própria diferença de geografia<br />
urbana entre as cidades.<br />
Por fim, o consórcio desenvolveu um<br />
conjunto de ferramentas para acessar<br />
e analisar o atlas do estudo global de<br />
metagenômica urbana.<br />
As ferramentas oferecem<br />
visualizações interativas dos<br />
resultados do estudo, os pipelines e<br />
figuras analíticas, entre outros. Todos<br />
os detalhes do estudo global e de<br />
outros realizados pelo grupo estão<br />
disponíveis no site metasub.org<br />
Referências<br />
Danko, David et al. “A global metagenomic map of urban<br />
microbiomes and antimicrobial resistance.” Cell, S0092-<br />
8674(21)00585-7. 2021, doi:10.1016/j.cell.2021.05.002<br />
Dulanto Chiang A, Dekker JP. From the Pipeline to the Bedside:<br />
Advances and Challenges in Clinical Metagenomics. J Infect<br />
Dis. 2020 ;221(Suppl 3):S331-S340. doi: 10.1093/infdis/jiz151.<br />
PMID: 31538184; PMCID: PMC7325616.<br />
Fadiji AE, Babalola OO. Metagenomics methods for the<br />
study of plant-associated microbial communities: A review.<br />
J Microbiol Methods. 2020 ;170:105860. doi: 10.1016/j.<br />
mimet.2020.105860. Epub 2020 Feb 4. PMID: 32027927.<br />
Laudadio I, Fulci V, Stronati L, Carissimi C. Next-Generation<br />
Metagenomics: Methodological Challenges and<br />
Opportunities. OMICS. 2019; 23(7):327-333. doi: 10.1089/<br />
omi.2019.0073. Epub 2019 Jun 12. PMID: 31188063.<br />
Wei, Fuwen et al. “Conservation metagenomics: a new branch<br />
of conservation biology.” Science China. Life sciences vol. 62,2.<br />
2019: 168-178. doi:10.1007/s11427-018-9423-3<br />
FONTE:<br />
Varsomics<br />
União de soluções tecnológicas para a prática da medicina de precisão. Nossa missão é ser referência de excelência no desenvolvimento de soluções<br />
de bioinformática e prestação de serviços aplicados na área de diagnóstico clínico e de pesquisas acadêmicas, para auxiliar a comunidade científica a<br />
difundir cada vez mais o conhecimento.<br />
114 <strong>Revista</strong> NewsLab <strong>Edição</strong> <strong>176</strong> | Março 2023