Revista Newslab Edição 176

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MEDICINA GENÔMICA especialmente para identificar se os ambientes urbanos possuem algum perfil específico de microbiota. Inicialmente, o estudo identificou cerca de 4 mil espécies conhecidas de microrganismos de áreas urbanas. Destes, identificaram um conjunto comum de 31 espécies de microrganismos em 97% das amostras analisadas. No entanto, os resultados de distribuição mostraram que cada cidade tem seu perfil molecular de microrganismos, como uma assinatura microbiana, que é impulsionada pela localização geográfica e climática. O estudo também identificou cerca de 11 mil vírus, 1300 bactérias, 2 Archaea e mais de 800 mil sequências CRISPr que não foram encontradas em bancos de dados de referência. Quanto ao perfil de resistência a antimicrobianos, os pesquisadores identificaram sequencias de genes AMR, no entanto não necessariamente de forma abundante. Na Oceania e no Oriente Médio, por exemplo, a análise identificou genes ARM com menor quantidade em relação a outros continentes. Isso pode ser resultado de perfis de utilização de antimicrobianos ou pela própria diferença de geografia urbana entre as cidades. Por fim, o consórcio desenvolveu um conjunto de ferramentas para acessar e analisar o atlas do estudo global de metagenômica urbana. As ferramentas oferecem visualizações interativas dos resultados do estudo, os pipelines e figuras analíticas, entre outros. Todos os detalhes do estudo global e de outros realizados pelo grupo estão disponíveis no site metasub.org Referências Danko, David et al. “A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance.” Cell, S0092- 8674(21)00585-7. 2021, doi:10.1016/j.cell.2021.05.002 Dulanto Chiang A, Dekker JP. From the Pipeline to the Bedside: Advances and Challenges in Clinical Metagenomics. J Infect Dis. 2020 ;221(Suppl 3):S331-S340. doi: 10.1093/infdis/jiz151. PMID: 31538184; PMCID: PMC7325616. Fadiji AE, Babalola OO. Metagenomics methods for the study of plant-associated microbial communities: A review. J Microbiol Methods. 2020 ;170:105860. doi: 10.1016/j. mimet.2020.105860. Epub 2020 Feb 4. PMID: 32027927. Laudadio I, Fulci V, Stronati L, Carissimi C. Next-Generation Metagenomics: Methodological Challenges and Opportunities. OMICS. 2019; 23(7):327-333. doi: 10.1089/ omi.2019.0073. Epub 2019 Jun 12. PMID: 31188063. Wei, Fuwen et al. “Conservation metagenomics: a new branch of conservation biology.” Science China. Life sciences vol. 62,2. 2019: 168-178. doi:10.1007/s11427-018-9423-3 FONTE: Varsomics União de soluções tecnológicas para a prática da medicina de precisão. Nossa missão é ser referência de excelência no desenvolvimento de soluções de bioinformática e prestação de serviços aplicados na área de diagnóstico clínico e de pesquisas acadêmicas, para auxiliar a comunidade científica a difundir cada vez mais o conhecimento. 114 Revista NewsLab Edição 176 | Março 2023
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