Promotion Wiebke Winkens Abgabeversion 2 - RWTH
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Material und Methoden<br />
Oligonukleotide für die Messung der GAPDH-mRNA-Expression (Referenzgen)<br />
Sequenz (5´ → 3`)<br />
GAPDH-F6 GAAGGTGAAGGTCGGAGTCA<br />
GAPDH-R114 AATGAAGGGGTCATTGATGG<br />
GAPDH-F6 GAAGGTGAAGGTCGGAGTCA<br />
GAPDH-R295 TGGACTCCACGACGTACTCA<br />
Produktgröße<br />
(bp)<br />
108<br />
289<br />
Oligonukleotide für die Methylierungs-spezifische PCR<br />
Sequenz (5´ → 3`)<br />
WNT2b-M-F GGTTCGTGCGTAATTTTGGAC<br />
WNT2b-M-R AAACCCATAAAATTCTTACTATATACTAAACACG<br />
WNT2b-U-F AGTTTTGTTGGTTTGTGTGTAATTTTGGATG<br />
WNT2b-U-R AAACCCATAAAATTCTTACTATATACTAAACACA<br />
3.5 Zelllinien<br />
Name Herkunftsgewebe<br />
HEY Ovar, Papilläres Zystadenokarzinom, Peritonealmetastase<br />
OV-4 Ovar, Karzinom<br />
SKOV-3 Ovar, Adenokarzinom, Aszitis<br />
3.6 Angaben zu den Tumorkollektiven<br />
Produkt<br />
größe<br />
(bp)<br />
3.6.1 Angaben zum „16 Normalgewebe-25 Tumorgewebe“-Mammakollektiv<br />
Für die Untersuchung der Frizzled-Gen-Expression wurden insgesamt 16 gutartige<br />
Brustgewebe und 25 Brustkrebsgewebe ausgewählt. Bei den malignen Brustgeweben<br />
wurde beachtet, dass viele verschiedene Entitäten berücksichtigt werden, gleichzeitig<br />
aber die Verteilung möglichst nahe an die reale Verteilung herankommt. Daher wurden<br />
20 duktale Karzinome, drei lobuläre Karzinome und zwei Karzinome anderer Entität<br />
ausgesucht. Alle Gewebe wurden mikrodisseziert und bei den Tumorgeweben wurde<br />
auf einen ungefähren Epithelanteil (Tumorzellanteil) von >70% geachtet, um eine<br />
Vergleichbarkeit der Ergebnisse zu gewährleisten.<br />
157<br />
166<br />
21
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