OncoGuia del consell i assessorament genètics en el càncer hereditari

30-40% de nous casos no existeixen antecedents familiars de PAF, i són probablementdeguts a mutacions de novo. 22Diagnòstic genèticEl gen APC va ser identificat fa 10 anys a la zona 5q21 delimitada per delecions presents enpacients amb PAF. Es considera que la majoria de les famílies afectes de PAF ho estan acausa de mutacions (majoritàriament mutacions puntuals si bé poden presentar-se gransdelecions) en el gen APC. Les mutacions germinals es localitzen en tota la regió codificant sibé predominen en la meitat 5' de l’exó 15 i en els exons 8 i 11, localitzant-se les mésfreqüents en els codons 1309 (18%) i 1061 (12%). Aquestes mutacions es detecten ambtècniques convencionals entre el 50-80% dels casos. Si bé inicialment s'havien reportatgrans delecions, només recentment s'han estudiat de manera sistemàtica i s'han detectatfins a un 10% dels casos.El diagnòstic genètic es basa en l'estudi molecular del cas índex. Per a això es podenutilitzar diferents mètodes de cribratge molecular segons l'experiència del centre queinclouen la seqüenciació directa, el SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism), laDGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis), la DHPLC (Denaturing High PerformanceLiquid Chromatography) o el PTT (test de la proteïna truncada). Per a aquestes tècniques espot utilitzar o RNA o DNA com material inicial. Si la tècnica utilitzada en un principi no haestat la seqüenciació directa, les possibles alteracions que es detectin hauran de serconfirmades mitjançant aquesta tècnica, que és considerada el gold standard per a lacaracterització de les mutacions. Aquestes tècniques haurien de cobrir la majoria de laseqüència codificant del gen.En cas de ser l'estudi negatiu caldria estudiar la presència de grans delecions en el gen. Pera això es poden utilitzar tècniques basades en la PCR (Polymerase Chain Reaction)quantitativa, els resultats de la qual hauran de ser confirmats mitjançant altres tècniquesabans d'utilitzar-se a la clínica.Quan no s'ha aconseguit detectar la mutació implicada en la PAF mitjançant les tècniquesanteriors es pot oferir diagnòstic indirecte en famílies grans (si es disposa de sang de tresmembres afectes, o de dos membres afectes i dels dos progenitors del familiar a estudiar).Aquest es porta a terme utilitzant 6 marcadors polimòrfics flanquejants al gen APC (D5S299,D5S82, D5134, D5S122, D5S346 i D5S318), fet que permet confeccionar l’haplotip de riscper a la família.Indicacions i utilitat clínica de l'estudi genètic1. Confirmació diagnòstica de PAF havent-se realitzat prèviament el diagnòstic clínic dePAF o en presència d'antecedents familiars de PAF.2. Cribratge molecular de PAF (diagnòstic presimptomàtic).33