12.06.2015 Views

Pseudomonas syringae DC3000 levaansukraasi Lsc3 katalüütilise ...

Pseudomonas syringae DC3000 levaansukraasi Lsc3 katalüütilise ...

Pseudomonas syringae DC3000 levaansukraasi Lsc3 katalüütilise ...

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

Asp225Asn puhul aga puhastatud valke. Varem on meie töörühmas näidatud, et muteerimata<br />

<strong>Lsc3</strong> valgu TA on 76% (T. Visnapuu, avaldamata andmed). Antud töös tehtud katse näitas, et<br />

valgu <strong>Lsc3</strong> Asp62Ala mutandi TA on tunduvalt langenud – 37%-ni. Asp219Ala ja Glu303Ala<br />

mutantidel polnud TA muutunud ning sarnanes metsiktüüpi valguga. Siinkohal peab<br />

arvestama, et nendel mutantidel olid rakulüsaatides eriaktiivsused väga väikesed (vt. Tabel 3),<br />

mistõttu ei pruugi saadud tulemused olla tõepärased ning määramisi tuleks korrata puhastatud<br />

preparaatidega. Puhastatud <strong>Lsc3</strong> P222L, D225A ja D225N valkudel polümeriseerivas<br />

aktiivsuses olulisi erinevusi, võrreldes metsiktüüpi valguga, ei leitud. Kirjandusest võib leida<br />

andmeid, kus <strong>levaansukraasi</strong>de katalüütilise kolmiku aminohapete muteerimisel TA on jäänud<br />

samuti väga sarnaseks muteerimata algsele valgule, näiteks Z. mobilis’e LevU korral, kus<br />

stabiliseerija mutandil Asp194Asn oli TA samasugune nagu metsiktüüpi valgul (Yanase et<br />

al., 2002).<br />

Mutantsete <strong>levaansukraasi</strong>de reaktsiooniprodukte uurisime ka õhukese kihi kromatograafiaga<br />

(TLC) (Joonis 6). Reaktsioonisegud ja TLC tehti, nagu on näidatud eespool (pt. 2.2.5 ja<br />

2.2.8).<br />

1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9.<br />

Joonis 6. Mutantsete valkude polümerisatsiooniproduktide lahutamine õhukese kihi<br />

kromatograafiaga. Reaktsioonisegud sisaldasid 1.2 M sahharoosi. Rajad: 1. markerid: levaan<br />

(2%), kestoos PA 3 (25 mM) ja fruktoos (0.1 M); 2. Markerid: nüstoos PA 4 (25 mM) ja<br />

sahharoos (0.1 M); 3. <strong>Lsc3</strong> wt puhastatud valk; 4. <strong>Lsc3</strong> D62A; 5. <strong>Lsc3</strong> D219A; 6. <strong>Lsc3</strong><br />

E303A; 7. <strong>Lsc3</strong> D225A; 8. <strong>Lsc3</strong> D225N; 9. <strong>Lsc3</strong> P222L. F – fruktoos; S – sahharoos; K –<br />

kestoos; N – nüstoos; L – levaan.<br />

Õhukese kihi kromatograafiaga saadud tulemuste analüüs kinnitas, et <strong>Lsc3</strong> mutantsetel<br />

valkudel D62A, D219A ning E303A polümeriseeriv aktiivsus praktiliselt puudus: tekkinud oli<br />

väga vähe polümerisatsiooniprodukte. Kõige inaktiivsem tundus olevat D62A mutant, sest<br />

peale substraadina reaktsioonisegusse lisatud sahharoosi polnud muid komponente võimalik<br />

32

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!