V 32 N 69 F.P
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ANÁLISIS DE SECUENCIAS HOMÓLOGAS DE SNE1 EN PHYTOPHTHORA CAPSICI<br />
lleva a la muerte celular programada de las células, tanto de<br />
las infectadas como las periféricas (Tyler, 2011). Entre los<br />
patógenos que afectan a las plantas se encuentra<br />
Phytophthora capsici, el cual pertenece al grupo de los<br />
oomicetos. P. capsici es un patógeno dinámico y muy<br />
destructivo de varios vegetales, tales como, el melón, la<br />
sandía, el chile, pimiento, pepino, la papa, habas, entre otros,<br />
que en los últimos años ha incrementado la ocurrencia y<br />
severidad del patógeno. Pérdidas multi billonarias son<br />
provocadas al año tanto por P. infestans como P. capsici<br />
(Lamour, et al 2012). Se ha intentado controlar la infección<br />
causada por Phytophthora capsici mediante varias estrategias<br />
que han tenido poco éxito. Esto pude deberse, a que en<br />
estudios recientes del género Phytophthora, se ha demostrado<br />
que éstos pueden tener cierta resistencia hacia los<br />
tratamientos que se han intentado implementar para poder<br />
combatirlo. El tratamiento con químicos, la rotación de<br />
cultivos, la fumigación, entre otros, no han sido del todo<br />
efectivos debido a la gran diversidad genética con la que<br />
cuenta este patógeno. Se ha visto que cada aislamiento es<br />
diferente y que muestra una resistencia diferente. Incluso, se<br />
ha llegado a comprobar, que este patógeno crea resistencia a<br />
los fungicidas con facilidad, lo que hace más difícil de<br />
combatir (Hausbek y Lamour, 2004; Granke, Lamour y<br />
Hausbek, 2012). Dentro de las moléculas que utilizan los<br />
fitopatógenos, incluyendo bacterias, hongos y oomicetos, en<br />
contra de las defensas de la planta, son efectores capaces de<br />
penetrar el citoplasma de las células del huésped. Se puede<br />
definir a un efector como las proteínas o moléculas del<br />
patógeno que alteran la estructura celular del huésped y sus<br />
funciones (Torto-Alalibo, et al., 2009). Una de las principales<br />
funciones de una proteína efectora es suprimir la señal que<br />
interviene en la respuesta de defensa de la planta. Las plantas<br />
también producen numerosos receptores que contienen un<br />
sitio de unión a nucleótido (NBS, por sus siglas en inglés) y<br />
un dominio con repeticiones ricas en leucinas (LRR, por sus<br />
siglas en inglés) que pueden detectar la presencia de<br />
proteínas de los patógenos que han penetrado el citoplasma<br />
(Jones y Dangl, 2006). El reconocimiento de proteínas<br />
efectoras mediante proteínas NB-LRR activa una efectiva<br />
respuesta de defensa que se conoce como inmunidad activada<br />
por el efector (ETI). Debido a que esta inmunidad puede<br />
proporcionar una defensa muy eficaz, los genes de las plantas<br />
codifican proteínas NB-LRR que reconocen la presencia de<br />
efectores específicos de los patógenos y se les conoce como<br />
genes de resistencia (R). Los efectores que son reconocidos<br />
por las proteínas NB-LRR han sido nombrados proteínas<br />
“avirulentes” (Avr) (Tyler, 2009). La proteína efectora<br />
presente en Phytophthora infestans, tiene relación con la<br />
supresión de la muerte celular programada. Esta proteína<br />
efectora fue nombrada SNE1 (supresor of necrosis 1, por sus<br />
siglas en inglés) la cual se expresa, específicamente, durante<br />
la fase biotrófica. Mediante la técnica de agroinfiltración se<br />
comprobó que SNE1 se encuentra relacionado con la<br />
supresión de la muerte celular programada en plantas de<br />
Nicotiana benthamiana y tomate. Se ha propuesto que SNE1<br />
se une a las proteínas avirulentas y estas ya no son<br />
reconocidas por los genes de resistencia lo que lleva a la<br />
supresión de la PCD (Kelley, et al., 2010). Por lo que el<br />
objetivo del presente trabajo fue detectar la expresión del gen<br />
Sne1 durante el inicio de la interacción entre Phytophthora<br />
capsici y Capsicum chinense.<br />
MATERIALES Y MÉTODOS<br />
Material biológico<br />
Se emplearon plantas de Capsicum chinense de la variedad<br />
criollo, con una altura de alrededor de 10 cm y 40 días de<br />
edad. Fueron crecidas en condiciones de invernadero con un<br />
riego cada tercer día. Phytophthora capsici fue donada, por<br />
el laboratorio del Dr. José Juan Zúñiga del Centro de<br />
Investigación Científica de Yucatán (CICY). La cepa fue<br />
mantenida en Agar Papa Dextrosa (PDA) incubado a 28ºC en<br />
oscuridad. La resiembra fue realizada cada 15 días.<br />
Diseño de Cebadores<br />
Se utilizaron secuencias de sne1 de Phytophthora infestans,<br />
Phytophthora ramorum y Phytophthora sojae obtenidas del<br />
NCBI, para encontrar las secuencias idénticas por medio de<br />
un BLAST en el genoma de Phytopthora capsici depositado<br />
en: http://genome.jgi.doe.gov/PhycaF7/PhycaF7.home.html.<br />
Las secuencias que presentaron arriba del 90% de identidad<br />
fueron empleadas para el diseño de cebadores utilizando el<br />
programa Primer Design de IDT. Tabla 1.<br />
Tabla 1. Cebadores diseñados para la amplificación de un fragmento del<br />
gen SNE1.<br />
Infección de plantas<br />
La infección se realizó de acuerdo con el protocolo de Nuñez-<br />
Pastrana, et al., (2011) el cual consiste, en adicionar un cubo<br />
de agar de 0.5 cm3 con crecimiento de Phytophthora capsici.<br />
El agar con P. capsici se colocó en una herida de 0.5 cm<br />
ubicada en el tallo a 2 cm de la superficie de la tierra. Se<br />
tomaron muestras a las 3, 6, 12, 24, 36, 48, 60 y 72 horas. Las<br />
muestras fueron almacenadas a -80ºC. Este experimento se<br />
realizó por triplicado.<br />
Extracción de ARN<br />
Se evaluaron cinco protocolos de extracción: el método de<br />
Valenzuela, et al, (2005) el Plant/Fungi RNA purification kit<br />
58 REVISTA DEL CENTRO DE GRADUADOS E INVESTIGACIÓN. INSTITUTO TECNOLÓGICO MÉRIDA Vol. <strong>32</strong> NÚM. <strong>69</strong>