Impact des mÃ©taux lourds sur les interactions plante/ver de terre ...

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log CFU.g-1 solPartie C : Résultats – Chapitre C-IIIcontre, les densités ne sont pas significativement différentes entre les 3 traitements enprésence de ver ou entre les 3 traitements sans ver (Figure 40).tel-00486649, version 1 - 26 May 2010109876543210AgP/SPAgP/SPVDensité bactérienneTémoins Pb+ (500mg.kg-1) Pb++ (1000mg.kg-1)Figure 40 : Densité bactérienne des agrégats racinaires dans différents traitementsEchantillonsAgP/T/SPAgP/Pb+/SPAgP/Pb++/SPAgP/T/SPVAgP/Pb+/SPVAgP/Pb++/SPVDensité bactérienne(logCFU/g sol)5,18 ± 0,00 (a)5,71 ± 0,58 (a)5,97 ± 0,00 (a)7,08 ± 0,77 (b)7,38 ± 0,00 (b)7,56 ± 1,09 (b)Tableau 12 : Densité bactérienne des agrégats racinairesA.2 Diversité génétiqueLes résultats de la numération bactérienne cultivable montrent donc que la présence deP. corethrurus augmente la densité bactérienne. Cependant, la méthode utilisée (culture surmilieu) est restrictive puisque d’une part nombre d’espèces bactériennes ne sont pascultivables, d’autre part le milieu utilisé, même s’il est généraliste, peut limiter ledéveloppement de certaines souches et en favoriser d’autres. C’est pourquoi afin de préciserla structure et la diversité des communautés bactériennes mises en cause nous avons utilisépour la suite de l’étude une méthode moléculaire palliant les limitations des méthodes91
AgV/T/SVS /T/SVAgP/T/SPS/T/SPAgP/T/SPVAgV/T/SPVS/T/SPVAgV/Pb+/SVS/Pb+/SVAgP/Pb+/SPS/Pb+/SPAgP/Pb+/SPVAgV/Pb+/SPVS/Pb+/SPVAgV/Pb++/SVS/Pb++/SVAgP/Pb++/SPS/Pb++/SPAgP/Pb++/SPVAgV/Pb++/SPVS/Pb++/SPVPartie C : Résultats – Chapitre C-III« culture-dépendantes » (Ranjard et al., 2000) : la technique de la PCR-DGGE. Le coupled’amorces utilisé est donné dans la partie matériel et méthodes.Les résultats présentés ont été obtenus avec un gradient de dénaturation de 30-60%(Figure 41) et un pourcentage d’acrylamide de 8 %. Pour chaque échantillon, 3 répétitions ontété effectuées sur 3 gels différents. Les profils DGGE ont été ensuite analysés par le logicielGelCompact.Marqueurtel-00486649, version 1 - 26 May 2010T- Pb+ Pb++Figure 41 : Les profils DGGE bactériens des agrégats racinaires et des agrégats de la drilosphère(Gradient de migration 30-60%)92
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4. Discussion…………………
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Introduction généraledifférentes
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