Impact des métaux lourds sur les interactions plante/ver de terre ...

Partie C : Résultats – Chapitre C-IIItel-00486649, version 1 - 26 May 2010conçues pour l’identification des bactéries Gram négatif et contiennent des substratsappropriés pour ce groupe de microorganismes. Analogiquement, les plaques Biolog GP2sont adaptées à l’identification de bactéries à Gram positif. Ces dernières années, les plaquesGN2 et GP2 ont été utilisées pour la recherche en écologie microbienne bien qu’une fois deplus ce type de méthode ne concerne que les bactéries susceptibles de pousser dans le milieude culture proposée (Konopka et al., 1998). Les profils métaboliques obtenus par Biolog nereflètent pas la diversité fonctionnelle réelle (Lindstom et al., 1998) et ne mesurent pas lepotentiel fonctionnel des bactéries numériquement dominantes mais plutôt celui des bactériesà croissance rapide (Smalla et al., 1998). Pourtant, c’est une technique rapide qui fournit bonnombre d’informations sur les communautés bactériennes et qui est donc fréquemmentutilisée pour étudier la réponse métabolique des communautés microbiennes de la rhizosphère(Söderberg et al., 2004 ; Baudoin et al., 2001 ; Grayston et al., 1998). La plaque EcoPlates deBiolog a aussi été utilisée pour déterminer l’effet toxique des métaux sur le fonctionnementbiologique du sol et contrôler son impact sur la phytoextraction (Epelde et al., 2008). Commeil a déjà été montré dans des études précédentes, les capacités de dégradation potentielle de lacommunauté microbienne sont le plus souvent considérablement réduites dans des solscontaminés par les métaux lourds (Knight et al., 1997 ; Kelly et Tate, 1998 ; Ellis et al.,2001). En présence de plante, le nombre de substrats utilisés est plus élevé que sans plante cequi suggère un effet stimulant de la plante probablement en raison des exsudats racinaires(Heinonsalo et al., 2000 ; Epelde et al., 2008). Dans notre cas, les activités augmentent avecla teneur en Pb, ceci est en accord avec les résultats obtenus avec T. caerulescens (Kozdrój etvan Elsas, 2000).Dans notre étude, l’analyse des profils physiologiques avec les plaques Biolog met enévidence que la présence du ver augmente la diversité fonctionnelle bactérienne, Walke etParkinson (2003) ont fait des observations identiques dans des microcosmes soumis àl’influence du ver de terre Aporrectodea trapezoides. Comme la diversité taxonomique est,d’après nos études précédentes, restée stable, elle ne peut expliquer ce résultat. On peut alorsformuler l’hypothèse que certaines bactéries ont été stimulées par l’activité des vers de terresoit après passage par le tractus digestif du ver (Kersante et al., 2006 ; Lavelle et al., 1995 ;Martin et al., 1987) soit par une modification du type de matières organiques disponibles(Welke et Parkinson, 2003). Ainsi, l’étude d’un autre ingénieur de l’écosystème, le termitehumivore, a montré que la zone du sol influencée par l’activité de ces insectes (termitosphère)contient des composés organiques plus abondants et plus polymérisées que le sol témoin (Lee,114