Impact des métaux lourds sur les interactions plante/ver de terre ...

Partie C : Résultats – Chapitre C-IIIComparaison du profil DGGE entre les agrégats racinaires de la plante cultivée avecou sans ver de terreBien que tous les types d’échantillons aient été traités, nous avons, dans un premiertemps, limité notre analyse aux agrégats racinaires (AgP) des systèmes SP et SPV avec lesdifférents traitements au plomb (T, Pb+ et Pb++).Quel que soit le traitement, les profils obtenus sont très voisins avec un nombre debandes qui varie d’environ 20 bandes pour les agrégats racinaires des traitements témoinssans plomb à environ 22 bandes pour ceux des traitements à 1000 mg Pb.tel-00486649, version 1 - 26 May 2010Certaines différences peuvent cependant être observées :‣ Les bandes 10 et 12 ne sont présentes que dans les agrégats racinaires des plantescultivées avec 1000 mg Pb kg -1 .‣ La bande 11 n’existe que dans les agrégats racinaires des plantes cultivées enprésence de vers et avec un taux de Pb++.‣ Les bandes 21 et 25 présentent une forte intensité dans les agrégats racinaires desplantes cultivées d’une part en absence de vers et avec une forte concentration enplomb et d’autre part dans ceux des plantes cultivées avec vers et sans plomb.L’analyse en composante principale, réalisée à partir de la disposition et de l’intensitédes bandes obtenues sur le gel donne un cercle de corrélation dont les 3 premiers axesexpliquent 48,56 % de l’inertie totale (soit 19,61 % ; 17,21 % ; 11,74 % pour les axes 1, 2 et3, respectivement). Les variables (les bandes détectées) sont représentées dans le cercle descorrélations avec les deux premiers axes en Figure 42A. La disposition des échantillons sur ledendrogramme montre bien qu’il y a une grande différence entre les 3 replicats d’un mêmesystème (Figure 42B).Deux types d’analyse ont été réalisés, l’une en fonction de la présence ou de l’absencede vers (Figure 42C) et l’autre selon la teneur en Pb des échantillons (Figure 42D). L’ACP nepermet pas de séparer les échantillons avec vers de ceux sans vers bien que quelquesdifférences dans le nombre et l’intensité des bandes soient visibles sur le gel. L’analysediscriminante réalisée sur 10000 permutations confirme que la séparation des traitements SPet SPV sur l’ACP n’est pas significative.93