Impact des métaux lourds sur les interactions plante/ver de terre ...

Partie A : Synthèse bibliographiqueII.2 Structure de la communauté microbienne (génétique et fonctionnelle)tel-00486649, version 1 - 26 May 2010Le stress par les métaux lourds entraîne des modifications plus ou moins drastiques dansla structure des communautés microbiennes telluriques. Les études de l’impact de métauxlourds sur la diversité de la communauté bactérienne dans le sol ont montré surtout uneinfluence négative (Hirsch et al., 1993 ; Hinojosa et al., 2005 ; Moffett et al., 2003 ; Smit etal., 1997 ; Sandaa et al., 2001). Les bactéries et les champignons isolés à partir de sols polluéssont plus tolérants à une forte contamination par les métaux lourds que ceux des sols nonpollués (Doelman et al., 1994 ; Huysman et al., 1994 ; Mertens et al., 2006). L’ajout demétaux lourds entraîne donc la disparition des populations les plus sensibles etsubséquemment l’adaptation des populations les plus résistantes. Ainsi, les équilibres peuventbasculer et les dominances s’inverser (Díaz-Roviňa et Bååth, 1996). Il a été montré que lesmodifications des communautés suite à la présence de cuivre pouvaient entraîner uneaugmentation de la proportion relative des bactéries Gram négatifs (Protéobactéries)(Turpeinen et al., 2004) ou au contraire des Gram positifs (Firmicutes) (Ekelund et al., 2003).Rasmussen et Sørensen (2001) ont analysé l’effet du mercure sur la diversité bactérienne encalculant l’indice de diversité de Shannon à partir des bandes obtenues en électrophorèseDGGE. Ils ont montré qu’après une légère diminution de la diversité, celle-ci tendait àaugmenter lentement et constamment le reste du temps de l’expérience. La diversité estimée àla fin de l’incubation est supérieure à la diversité initiale. Ces résultats suggèrentl’établissement d’une nouvelle communauté adaptée, caractérisée par de nouvelles espècesdominantes et par une diversité plus importante (Rasmussen et Sørensen, 2001).II.3 Activité enzymatiqueD’autres propriétés biologiques largement étudiées dans les études d’impact concernentles activités enzymatiques, dont les activités respiratoires. L’effet néfaste des métaux lourdssur les activités enzymatiques du sol a souvent été souligné (Renella et al., 2003 ; Landi et al.,2000 ; Kandeler et al., 1996 ; Kuperman et Carreio, 1997 ; Haanstra et Doelman, 1991 ;Hattori, 1992). La sensibilité des activités vis-à-vis des métaux peut dépendre du typed’enzyme (Renella et al., 2003). Dans une étude portant sur l’impact de différents métaux sur13 enzymes impliquées dans les cycles du carbone (C), de l’azote (N), du phosphore (P) et dusoufre (S), Kandeler et al. (1996) ont montré que la réduction de leurs activités était plus oumoins sévère : celles impliquées dans le cycle du carbone étaient moins affectées que celles13