Les mares temporaires méditerranéennes Volume 1

6. SuiviHyla meridionalis, grimpe facilement sur ce genre d’obstacle.L’impact sur l’environnement est par ailleurs non négligeable. Deplus, les risques de prédation et de mortalité sont élevés sur les animauxcaptifs, ce qui nécessite des contrôles réguliers, au moinstous les deux jours et donc un grand investissement en temps.• Le capture/marquage/recapture (CMR) a consiste à marquer, lorsde deux sessions ou plus, tous les individus capturés. A partir destaux de recaptures, on obtient par quelques calculs simples uneestimation de la taille de la population. Cette méthode présupposeun certain nombre de conditions rarement remplies dans les populationsd’amphibiens : absence d’émigration-immigration, absencede mortalité, égalité de probabilité de capture entre les individus,etc. Elle nécessite de bien connaître la biologie de l’espèce pour êtreappliquée avec sécurité. Certaines espèces (Pélobate, Discoglosse)restent en effet très peu de temps sur le site de reproduction, avec unfort renouvellement d’une soirée à l’autre, ce qui invalide la méthode.Au-delà d’une estimation de la population, la technique permet d’obtenirdes informations sur la dynamique de la population, au traversdes histoires de vie individuelles (voir démographie ci-dessous).Les méthodes de marquage varient selon les espèces. Le marquagecollectif est souvent suffisant pour une estimation de la taillede la population. Pour cela, il existe plusieurs méthodes : photoidentification,marquage à l’aide de colorants vitaux, amputationd’un doigt, tatouage, implantation d’une puce électronique. Lemarquage individuel donne accès à plus d’informations : survieindividuelle à l’aide des techniques de CMR, fidélité au site, etc. Laphoto-identification est possible chez les espèces ayant un dessinventral ou dorsal complexe (salamandres, tritons crêtés et marbrés,crapauds sonneurs, pélobates). Elle trouve ses limites lorsque lapopulation est grande (supérieure à 200 individus) en raison du tempsnécessaire à la reconnaissance de l’animal. Le marquage par transpondeur(“puce” électronique), implanté sous la peau, constitueune méthode alternative, valable pour toutes les espèces de taillesuffisante.DémographieOn vise ici à répondre à des questions précises, telles que : “lerecrutement* en jeunes individus dans la population est-il suffisantpour assurer sa survie ?” ou “la population est-elle stable, endéclin ou en augmentation ?” Pour répondre à ce type de question,la méthode la plus adaptée est la méthode de CMR qui consiste àétudier le devenir dans le temps d’un échantillon représentatifd’individus (histoire de vie des individus). Une méthode alternativeconsiste à analyser la structure de la population et son évolutiondans le temps.• Estimation des taux de survie individuel et tendance démographiquede la population : sur le plan technique, la méthode consisteà capturer un échantillon suffisant d’individus (représentatifs de lapopulation), les marquer durablement et en faire un suivi dans letemps. Pour la capture, on utilisera les techniques précédemmentévoquées (captures de nuit sur les sites de reproduction, clôturesavec pièges, pièges-abris, etc.). Le marquage individuel fait appelaux techniques exposées plus haut. La qualité des résultats dépendraessentiellement de plusieurs facteurs : la proportion d’individusmarqués dans la population, le taux de recapture de cesindividus et la durée du suivi. Pour estimer un taux de survie uneannée donnée, un suivi de trois ans est nécessaire (une année encadréepar deux années) ; pour estimer une tendance, plusieurs annéessont nécessaires (au moins le temps de génération de l’espèce). Ils’agit donc d’une technique coûteuse en temps et nécessitant unegrande rigueur. Elle ne peut s’appliquer que dans des conditionsbien particulières : population bien identifiée dans l’espace et dansle temps, bonne connaissance de la biologie de l’espèce et des facteurspouvant influer sur la survie des animaux. Il ne s’agit doncpas d’une technique de routine applicable par un gestionnaire.• Structure démographique des populations et suivi des cohortes* :la méthode consiste à estimer l’importance relative des différentescohortes (années de naissance ou classes d’âge) dans la population.Pour identifier les cohortes, on peut faire appel aux mesures detaille ou de poids des animaux (classes de taille ou de poids) ou àleur âge par la technique de la squelettochronologie* (voir Jakobet al. 199 ). Cette méthode est applicable sur des coupes osseuses dephalanges, prélevées sur les animaux vivants. Elle permet de lireles lignes d’arrêt de croissance hivernale et dans certains cas, laligne de naissance, ce qui renseigne directement sur l’âge de l’individu.Délicate à mettre en œuvre, la squelettochronologie estlimitée aux spécialistes autorisés et peu adaptée à un suivi.Dans la pratique, sauf exception, il est préférable de s’en tenir à desmesures de taille qui séparent quelques classes d’âge seulement(première année, deuxième année et adultes, dans la plupart descas) mais qui peuvent révéler des dysfonctionnements majeurs :absence de recrutement durant plusieurs années, par exemple.Les différentes méthodes décrites sont récapitulées dans letableau 21 et évaluées en terme de temps, de coût et de niveau deconnaissances requis.a. Les expérimentations avec marquage des individus et de squelettochronologie quinécessitent l’amputation d’une phalange des animaux, ne sont pas bénignes. Ellesrequièrent des demandes préalables d’autorisation dans lesquels il est clairement stipuléque les animaux ne seront pas tués. En France, ces demandes doivent être présentéesauprès des DIREN qui les font ensuite parvenir au Ministère de l’Ecologie etdu Développement Durable.Tableau 21. Evaluation des méthodes de suivi des amphibiensMéthode Objectif Temps Coût ConnaissancesnécessairesObservation de nuitComptage auditifEpuisettePièges pour larvesEfficacité dela techniqueInventaire * * * *Taille population ** * * *Démographie - - - -Inventaire * * ** **Taille population ** * ** **Démographie - - - -Inventaire ** * *** ***Taille population - - - -Démographie - - - -Inventaire * *** *** **Taille population - - - -Démographie - - - -Clôtures à amphibiens Inventaire ** ** * ***Taille population *** ** * **Démographie *** ** ** ***Marquage collectifMarquage individuel* = faible, ** = modéré, *** = importantInventaire - - - -Taille population ** ** ** **Démographie ** * *** **Inventaire - - - -Taille population *** *** ** ***Démographie *** *** *** ***103