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Capitolo 5 Analisi dell'esperimento Visualizzazione Plot di amplificazione Come visualizzare plot multipli simultaneamente I plot multipli visualizzano fino a quattro plot per una analisi simultanea. È possibile visualizzare ogni plot singolarmente, due plot come righe o colonne oppure tutti i plot in una matrice 2 ✕ 2. Per rivedere i risultati nei plot multipli: 1. Nella colonna di navigazione, selezionare Multiple Plots View (Visualizza plot multipli). 2. Fare clic su per visualizzare due plot in parallelo. 3. Nel plot superiore, selezionare Amplification Plot (Plot di amplificazione) (∆R n rispetto al ciclo) per visualizzare i risultati della sessione di amplificazione per ogni pozzetto selezionato nel layout di piastra. 4. Nel plot inferiore, selezionare Raw Data Plot (Plot dei dati non elaborati) per visualizzare i dati non elaborati per ogni pozzetto selezionato nel layout di piastra. 2 3 1 4 Note 90 Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di genotipizzazione RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.
Capitolo 5 Analisi dell'esperimento Visualizzazione delle impostazioni di analisi Per ulteriori informazioni Per ulteriori informazioni sul Plot di amplificazione o sulla visualizzazione dei plot multipli accedere alla voce Help (Guida) del software StepOne facendo clic su o selezionando Help (Guida)StepOne Help (Guida StepOne). Visualizzazione delle impostazioni di analisi Nel caso non si sia soddisfatti della modalità con la quale il software StepOne richiede i genotipi o le soglie degli indicatori CQ, rivedere e regolare le impostazioni di analisi e/o le richieste come necessario. Informazioni sui dati dell'esempio Modifica delle impostazioni di analisi Nell'esperimento di esempio, rivedere e regolare le impostazioni di analisi come desiderato per imparare le modalità in cui le impostazioni di richiesta, del C T e degli indicatori contribuiscono all'analisi dei dati di genotipizzazione. 1. Nell'esperimento, fare clic su Analysis Settings (Impostazioni di analisi). 2. Selezionare C__11711420_30 dalla tabella Select a SNP Assay (Seleziona un saggio SNP). 3. Fare clic su Edit Default Settings (Modifica impostazioni predefinite). 4. Nel caso siano state eseguite richieste manuali, selezionare Keep Manual Calls from Previous Analysis (Mantieni richieste manuali dall'analisi precedente) nella casella di dialogo Edit Default SNP Assay Settings (Modifica impostazioni saggi SNP predefinite). 5. Nel campo Quality Value (Valore qualità), immettere un valore percentuale per applicarlo come intervallo di qualità per i campioni autocalling. A un valore maggiore corrisponde una richiesta di alleli più rigorosa. 6. Fare clic su Save Changes (Salva modifiche) per salvare le impostazioni. 7. Regolare le impostazioni del C T : a. Selezionare la scheda Ct Settings (Impostazioni Ct). b. Selezionare l'allele A dalla tabella Select an Allele (Seleziona un allele), quindi deselezionare Use Default Settings (Utilizza impostazioni predefinite), c. Deselezionare Automatic Threshold (Soglia automatica), quindi immettere un nuovo valore di soglia. d. Deselezionare Automatic Baseline (Linea di base automatica), quindi immettere nuovi valori della linea di base. e. Ripetere i passaggi 7b fino a 7d per l'allele C. Nota: Per ulteriori informazioni sull'impostazione dei cicli soglia per le esecuzioni di genotipizzazione, vedere la Guida software StepOne software Help. Note Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di genotipizzazione RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire. 91
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Guida introduttiva Applied Biosyste
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Capitolo 3 Preparazione delle reazi
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Premessa Come utilizzare questa gui
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Premessa Come ottenere assistenza D
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Premessa Convenzioni sulla sicurezz
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Premessa Etichette di sicurezza sug
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Premessa Sicurezza dalle sostanze c
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Premessa Sicurezza dei rifiuti chim
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Premessa Sicurezza LED Alimentazion
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Premessa Norme di sicurezza e di co
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Capitolo 1 Introduzione Informazion
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Capitolo 1 Introduzione Come utiliz
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Capitolo 2 Disegno dell'esperimento
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