Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...

Glossario
Plot di
amplificazione
Visualizzazione dei dati acquisiti durante la fase ciclica dell'amplificazione della PCR. È
visualizzabile come:
• Reporter normalizzato baseline-corretcted (∆R n ) rispetto al ciclo
• Reporter normalizzato (R n ) rispetto al ciclo
• Ciclo soglia (C T ) rispetto al pozzetto
Plot di
discriminazione
allelica
Plot
multicomponente
pozzetti IPC a
controllo negativo
pozzetti IPC
bloccati a controllo
negativo
profilo termico
punto
quantità
quantità di partenza
quantità
normalizzata
quantità standard
Visualizzazione dei dati acquisiti durante la lettura post-PCR. Il plot di discriminazione
allelica è una manifestazione grafica del segnale del reporter normalizzato proveniente
dalla sonda dell'allele 1, riportato rispetto al segnale del reporter normalizzato
proveniente dalla sonda dell'allele 2.
Visualizzazione dei dati acquisiti durante la fase ciclica della PCR in tempo reale. Il plot
multicomponente mostra la fluorescenza per tutti i cicli nella sessione analitica.
In esperimenti di presenza/assenza, i pozzetti che contengono un templato IPC e buffer o
acqua invece di un templato di campione nella reazione PCR. Solo il templato IPC
dovrebbe amplificarsi nei pozzetti IPC a controllo negativo, in quanto la reazione non
contiene templato di campione. Vedere anche IPC+.
In esperimenti di presenza/assenza, i pozzetti che contengono agente bloccante IPC
invece di un templato di campione nella reazione PCR. Nei pozzetti IPC bloccati a
controllo negativo non deve verificarsi alcuna reazione di amplificazione in quanto la
reazione non contiene alcun templato di campione e l'amplificazione dell'IPC è bloccata.
Chiamati anche Controllo senza amplificazione (NAC, No Amplification Control)
Parte del metodo di esecuzione che specifica temperatura, tempo, rampa e punti di
acquisizione dati per tutti i passaggi e le fasi della sessione analitica dello strumento.
Uno standard in una curva standard. La quantità di standard per ogni punto nella curva
standard viene calcolato in base alla quantità di partenza e al fattore seriale.
Negli esperimenti di quantificazione, la quantità di target presente nei campioni. La
quantità assoluta può riferirsi al numero di copie, alla massa, alla molarità o alla carica
virale. La quantità relativa si riferisce a n volte la differenza tra la quantità normalizzata
di target nel campione e la quantità normalizzata di target nel campione di riferimento.
Quando viene definita una curva standard o una serie di diluizioni standard, corrisponde
alla quantità maggiore o minore.
Quantità di target divisa per la quantità di controllo endogeno.
Quantità nota nella reazione PCR.
Per gli esperimenti con curva standard, la quantità nota di target. Le unità per la quantità
standard possono essere per la massa, il numero di copie, la carica virale o altre unità per
la misurazione della quantità di target.
Per gli esperimenti con curva standard relativa, quantità nota nello standard. Ad esempio,
la quantità nota può riferirsi alla quantità di cDNA o alla quantità di stock. Le unità non
sono rilevanti per gli esperimenti di curva standard relativa in quanto si annullano nei
calcoli.
Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di
genotipizzazione
RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.
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