Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...

Capitolo 3 Preparazione delle reazioni . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
Descrizione generale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
Preparazione delle diluizioni del campione . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
Preparazione della miscela di reazione . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
Preparazione della piastra di reazione . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
Capitolo 4 Esecuzione dell'esperimento . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
Descrizione generale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
Preparazione per l'esecuzione . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
(Opzionale) Abilitazione delle notifiche . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
Avvio dell'esecuzione . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Monitoraggio dell'esecuzione . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
Rimozione della piastra di reazione e trasferimento dei dati . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
Capitolo 5 Analisi dell'esperimento . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67
Descrizione generale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
Apertura dell'esperimento per l'analisi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
Visulizzazione del Plot di discriminazione allelica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
Visualizzazione del layout di piastra . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
Visualizzazione tabella Well (Pozzetto) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
Visualizzazione del riepilogo CQ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
Visualizzazione del Plot dei dati non elaborati . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82
Visualizzazione del Plot multicomponente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Visualizzazione Plot di amplificazione . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86
Visualizzazione delle impostazioni di analisi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
Pubblicazione dei dati . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96
Appendice A Flussi di lavoro degli esperimenti alternativi . . . . . . . . . . 97
Flusso di lavoro impostazione avanzata . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98
Flusso di lavoro avvio rapido . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
Flusso di lavoro del templato . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Flusso di lavoro esportazione/importazione . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
Bibliografia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113
Glossario . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115
Indice. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 129
iv
Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di
genotipizzazione