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Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...

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Capitolo 5 Analisi dell'esperimento<br />

Visualizzazione del layout di piastra<br />

Visualizzazione del layout di piastra<br />

Rivedere i risultati dell'esperimento nel layout di piastra. Il layout di piastra visualizza<br />

l'impostazione specifica per il saggio e le proprietà di analisi per l'esperimento in un<br />

formato dei pozzetti corrispondente al tipo di piastra di reazione utilizzata per<br />

l'esecuzione.<br />

Informazioni sui<br />

dai dell'esempio<br />

Per l'esperimento di esempio, verificare che il software StepOne abbia richiesto:<br />

• 6 campioni come omozigotici allele 1 (●)<br />

• 4 campioni come omozigotici allele 2 (●)<br />

• 12 campioni come eterozigotici (●)<br />

• 2 campioni come controlli negativi (■)<br />

Verificare che nessun pozzetto della piastra di reazione abbia attivato indicatori CQ.<br />

Visualizzazione<br />

del layout<br />

1. Fare clic sulla icona accanto al plot di discriminazione allelica per aumentare al<br />

massimo il layout di piastra.<br />

2. Fare clic su Show in Wells (Visualizza nei pozzetti), quindi selezionare o<br />

deselezionare un parametro da visualizzare con i pozzetti.<br />

3. Ripetere il passaggio 2 fino a quando il layout di piastra contenga tutti i parametri<br />

desiderati.<br />

Parametro<br />

Nome campione<br />

Operazione<br />

Nome saggio SNP<br />

ID saggio<br />

Allele 1 / Allele 2<br />

Coloranti allele 1 /<br />

Coloranti allele 2<br />

Colore saggio<br />

SNP<br />

Colore campione /<br />

Colore operazione<br />

Descrizione<br />

Il nome del campione applicato al pozzetto.<br />

L'operazione assegnata al pozzetto:<br />

• – Non nota<br />

• – Controllo negativo<br />

• – Controllo positivo<br />

Il nome dell'SNP valutato per il pozzetto.<br />

Il numero di ID del saggio dell'SNP valutato per il pozzetto.<br />

Il nome dell'allele associato per l'SNP valutato per il pozzetto.<br />

Il nome dei coloranti reporter e quencher dell'allele associato per l'SNP<br />

valutato per il pozzetto.<br />

Il colore dell'SNP valutato per il pozzetto.<br />

Il colore del campione o dell'operazione applicato al pozzetto.<br />

Note<br />

74<br />

Guida introduttiva al sistema <strong>Applied</strong> <strong>Biosystems</strong> StepOne <strong>Real</strong>-<strong>Time</strong> <strong>PCR</strong> <strong>System</strong> per gli esperimenti di<br />

genotipizzazione<br />

RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.

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