Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...
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Capitolo 5 Analisi dell'esperimento<br />
Visualizzazione del layout di piastra<br />
Visualizzazione del layout di piastra<br />
Rivedere i risultati dell'esperimento nel layout di piastra. Il layout di piastra visualizza<br />
l'impostazione specifica per il saggio e le proprietà di analisi per l'esperimento in un<br />
formato dei pozzetti corrispondente al tipo di piastra di reazione utilizzata per<br />
l'esecuzione.<br />
Informazioni sui<br />
dai dell'esempio<br />
Per l'esperimento di esempio, verificare che il software StepOne abbia richiesto:<br />
• 6 campioni come omozigotici allele 1 (●)<br />
• 4 campioni come omozigotici allele 2 (●)<br />
• 12 campioni come eterozigotici (●)<br />
• 2 campioni come controlli negativi (■)<br />
Verificare che nessun pozzetto della piastra di reazione abbia attivato indicatori CQ.<br />
Visualizzazione<br />
del layout<br />
1. Fare clic sulla icona accanto al plot di discriminazione allelica per aumentare al<br />
massimo il layout di piastra.<br />
2. Fare clic su Show in Wells (Visualizza nei pozzetti), quindi selezionare o<br />
deselezionare un parametro da visualizzare con i pozzetti.<br />
3. Ripetere il passaggio 2 fino a quando il layout di piastra contenga tutti i parametri<br />
desiderati.<br />
Parametro<br />
Nome campione<br />
Operazione<br />
Nome saggio SNP<br />
ID saggio<br />
Allele 1 / Allele 2<br />
Coloranti allele 1 /<br />
Coloranti allele 2<br />
Colore saggio<br />
SNP<br />
Colore campione /<br />
Colore operazione<br />
Descrizione<br />
Il nome del campione applicato al pozzetto.<br />
L'operazione assegnata al pozzetto:<br />
• – Non nota<br />
• – Controllo negativo<br />
• – Controllo positivo<br />
Il nome dell'SNP valutato per il pozzetto.<br />
Il numero di ID del saggio dell'SNP valutato per il pozzetto.<br />
Il nome dell'allele associato per l'SNP valutato per il pozzetto.<br />
Il nome dei coloranti reporter e quencher dell'allele associato per l'SNP<br />
valutato per il pozzetto.<br />
Il colore dell'SNP valutato per il pozzetto.<br />
Il colore del campione o dell'operazione applicato al pozzetto.<br />
Note<br />
74<br />
Guida introduttiva al sistema <strong>Applied</strong> <strong>Biosystems</strong> StepOne <strong>Real</strong>-<strong>Time</strong> <strong>PCR</strong> <strong>System</strong> per gli esperimenti di<br />
genotipizzazione<br />
RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.