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Capitolo 5 Analisi dell'esperimento Visualizzazione del layout di piastra Visualizzazione del layout di piastra Rivedere i risultati dell'esperimento nel layout di piastra. Il layout di piastra visualizza l'impostazione specifica per il saggio e le proprietà di analisi per l'esperimento in un formato dei pozzetti corrispondente al tipo di piastra di reazione utilizzata per l'esecuzione. Informazioni sui dai dell'esempio Per l'esperimento di esempio, verificare che il software StepOne abbia richiesto: • 6 campioni come omozigotici allele 1 (●) • 4 campioni come omozigotici allele 2 (●) • 12 campioni come eterozigotici (●) • 2 campioni come controlli negativi (■) Verificare che nessun pozzetto della piastra di reazione abbia attivato indicatori CQ. Visualizzazione del layout 1. Fare clic sulla icona accanto al plot di discriminazione allelica per aumentare al massimo il layout di piastra. 2. Fare clic su Show in Wells (Visualizza nei pozzetti), quindi selezionare o deselezionare un parametro da visualizzare con i pozzetti. 3. Ripetere il passaggio 2 fino a quando il layout di piastra contenga tutti i parametri desiderati. Parametro Nome campione Operazione Nome saggio SNP ID saggio Allele 1 / Allele 2 Coloranti allele 1 / Coloranti allele 2 Colore saggio SNP Colore campione / Colore operazione Descrizione Il nome del campione applicato al pozzetto. L'operazione assegnata al pozzetto: • – Non nota • – Controllo negativo • – Controllo positivo Il nome dell'SNP valutato per il pozzetto. Il numero di ID del saggio dell'SNP valutato per il pozzetto. Il nome dell'allele associato per l'SNP valutato per il pozzetto. Il nome dei coloranti reporter e quencher dell'allele associato per l'SNP valutato per il pozzetto. Il colore dell'SNP valutato per il pozzetto. Il colore del campione o dell'operazione applicato al pozzetto. Note 74 Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di genotipizzazione RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.
Capitolo 5 Analisi dell'esperimento Visualizzazione del layout di piastra Parametro Richiesta genotipo La richiesta di allele assegnata al campione: • ● Omozigotico 1/1 • ● Omozigotico 2/2 • ● Eterozigotico 1/2 • ■ Controllo negativo • ✕ Indeterminata Descrizione Indicatore Il numero di indicatori attivati dal pozzetto come elencato nel simbolo ▲. La figura seguente indica il layout di piastra dell'esperimento di esempio di genotipizzazione. 1 2 3 Linee guida analisi Per analizzare il proprio esperimento: • Il layout di piastra visualizza nell'angolo in basso a sinistra dei pozzetti omessi dall'utente; visualizza inoltre nell'angolo dei pozzetti omessi dalle impostazioni degli indicatori CQ. • Notare la posizione di alcuni campioni che attivano gli indicatori CQ (▲). La comprensione della posizione degli errori è di aiuto nella diagnosi di eventuali attività non riuscite. Note Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di genotipizzazione RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire. 75
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Guida introduttiva Applied Biosyste
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Premessa Come utilizzare questa gui
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Premessa Come ottenere assistenza D
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Premessa Convenzioni sulla sicurezz
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Premessa Sicurezza dalle sostanze c
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Premessa Norme di sicurezza e di co
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