Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...

Capitolo 5 Analisi dell'esperimento
Visualizzazione delle impostazioni di analisi
Assegnazione richieste automatica
1. Nell'esperimento, fare clic su Analysis Settings (Impostazioni di analisi).
2. Selezionare il saggio SNP desiderato dalla tabella Select a SNP Assay (Seleziona un
saggio SNP).
3. Fare clic su Edit Default SNP Assay Settings (Modifica impostazioni saggio SNP
predefinito).
4. Nel caso siano state eseguite richieste automatiche, selezionare Keep Manual Calls
from Previous Analysis (Mantieni le richieste manuali dalla precedente
analisi).
5. Selezionare Autocaller Enabled (Autocaller abilitato) per attivare l'analisi
automatica.
6. Se si prevede che i dati analizzati consistano unicamente in due cluster, selezionare
Richiesta 2-Cluster abilitata.
7. Nel campo Quality Value (Valore qualità), immettere un valore percentuale per
applicarlo come intervallo di qualità per i campioni autocalling. (A un valore
maggiore corrisponde una richiesta di alleli più rigorosa.)
8. Fare clic su Save Changes (Salva modifiche) per salvare le impostazioni.
9. (Opzionale) Assegnare gli indicatori:
a. Selezionare la scheda Flag Settings (Impostazioni indicatori).
b. Assegnare gli indicatori come desiderato.
Nota: Nella assegnazione degli indicatori, è possibile segnalare condizioni e
omettere pozzetti in base a criteri ben definiti (ad esempio, quando un pozzetto
presenta dati mancanti). Per ulteriori informazioni, vedere la Guida software
StepOne software Help.
c. Fare clic su Apply Analysis Settings (Applica impostazioni di analisi) per
chiudere la finestra di dialogo Analysis Settings (Impostazioni di analisi).
10. Fare clic su Reanalyze (Rianalizza) per analizzare i dati utilizzando le nuove
impostazioni.
Note
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Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di
genotipizzazione
RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.