Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...
Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...
Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Capitolo 5 Analisi dell'esperimento<br />
Visualizzazione delle impostazioni di analisi<br />
Assegnazione richieste manuale<br />
1. Nell'esperimento, fare clic su Analysis Settings (Impostazioni di analisi).<br />
2. Selezionare il saggio SNP desiderato dalla tabella Select a SNP Assay (Seleziona un<br />
saggio SNP).<br />
3. Specificare le impostazioni di analisi dell'evidenziatore:<br />
a. Fare clic su Edit Default SNP Assay Settings (Modifica impostazioni saggio<br />
SNP predefinito).<br />
b. Deselezionare l'Autocaller abilitato.<br />
c. Fare clic su Save Changes (Salva modifiche) per salvare le impostazioni.<br />
4. (Opzionale) Assegnare gli indicatori:<br />
a. Selezionare la scheda Flag Settings (Impostazioni indicatori).<br />
b. Assegnare gli indicatori come desiderato.<br />
Nota: Nella assegnazione degli indicatori, è possibile segnalare condizioni e<br />
omettere pozzetti in base a criteri ben definiti (ad esempio, quando un pozzetto<br />
presenta dati mancanti). Per ulteriori informazioni, vedere la Guida software<br />
StepOne software Help.<br />
c. Fare clic su Apply Analysis Settings (Applica impostazioni di analisi).<br />
5. Fare clic su Reanalyze (Rianalizza) per analizzare i dati utilizzando le nuove<br />
impostazioni.<br />
6. Nella colonna di navigazione, selezionare Allelic Discrimination Plot (Plot di<br />
discriminazione allelica).<br />
7. Selezionare un evidenziatore dal menu saggi SNP. Simboli a forma di X (✕ –<br />
Indeterminato) che rappresentano l'evidenziatore selezionato vengono visualizzati<br />
nel Plot di discriminazione allelica.<br />
8. Per assegnare richieste:<br />
a. Fare clic su (strumento di selezione).<br />
b. Fare clic-trascinare una casella intorno ai datapoint desiderati nel plot.<br />
c. Nel menu Apply Call (Applica richiesta), selezionare la richiesta desiderata.<br />
d. Ripetere i passaggi 8b e 8c per applicare le richieste ai datapoint rimanenti.<br />
9. Nel caso siano in atto richieste di assegnazione per SNP multipli, selezionare un<br />
evidenziatore differente dal menu a discesa dei saggi SNP e ripetere il passaggio 8.<br />
Note<br />
Guida introduttiva al sistema <strong>Applied</strong> <strong>Biosystems</strong> StepOne <strong>Real</strong>-<strong>Time</strong> <strong>PCR</strong> <strong>System</strong> per gli esperimenti di<br />
genotipizzazione<br />
RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.<br />
95
Change language