Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...

Capitolo 1 Introduzione
Informazioni sull'esperimento di esempio
Informazioni sull'esperimento di esempio
Per illustrare come eseguire gli esperimenti di genotipizzazione, questa guida conduce
l'utente attraverso i processi di disegno e analisi di un esperimento di esempio.
L'esperimento di esempio rappresenta una tipica impostazione che è possibile utilizzare
per familiarizzare rapidamente con il sistema StepOne .
Descrizione
Layout piastra di
reazione
L'obbiettivo dell'esperimento di genotipizzazione di esempio è quello di indagare
sull'SNP rs8039, dove possibili genotipi sono AA, AC e CC. Nell'esempio, 20 campioni
non noti di DNA genomico (gDNA) sono stati sottoposti a genotipizzazione utilizzando
il saggio TaqMan ® Drug Metabolism Genotyping Assay con ID C__11711420_30. Le
reazioni sono state impostate in modo tale che le sonde e i primer PCR, il target e
entrambi gli alleli dell'SNP rs8039 siano presenti nello stesso pozzetto. La PCR è stata
eseguita utilizzando la Master Mix TaqMan ® Universal PCR e secondo il protocollo
descritto nella scheda di riferimento rapido Performing a TaqMan ® Drug Metabolism
Genotyping Assay for 96-Well Plates Quick Reference Card (n. di cat. 4367636A).
Il layout della piastra di reazione per l'esperimento di esempio è indicato qui di seguito.
Informazioni sui
dai dell'esempio
L'esperimento di esempio descritto in questa guida è incluso nel software StepOne . È
possibile trovare il file per l'esperimento (Genotyping Example.eds) sul proprio
computer:
:\Applied Biosystems\StepOne System\experiments\examples
dove indica il disco rigido del computer sul quale è stato installato il software
StepOne . L'unità predefinita di installazione è l'unità C.
Note
10
Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di
genotipizzazione
RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.