Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...

Glossario
Concentrazione del
campione diluito
(10✕ per Miscela di
reazione)
configurazione colocata
configurazione
indipendente
controllo endogeno
controllo negativo
(NC, Negative
Control)
controllo positivo
controllo positivo
interno (IPC)
controllo senza
amplificazione
(NAC, No
Amplification
Control)
controllo senza
templato (NTC, No
Template Control)
C T
C T automatico
Campo software visualizzato sulla scheda Sample Dilution Calculations (Calcoli
diluizione campione) della schermata Reaction Setup (Impostazione reazione). Per questo
campo, immettere la concentrazione del campione che si desidera utilizzare da
aggiungere alla miscela di reazione per tutti i campioni nell'esperimento. “10✕ per
Miscela di reazione” indica che il software presuppone che il componente campione o
standard della miscela di rezione si trovi in concentrazione 10✕. Ad esempio, se la
concentrazione del campione diluito è di 50,0 ng/µl (10✕), la concentrazione finale del
campione nella reazione è di 5 ng/µl (1✕).
Disposizione del sistema in cui lo Strumento StepOne è collegato direttamente a un
computer co-locato dal cavo giallo del Sistema StepOne . In questa configurazione, lo
Strumento StepOne viene controllato attraverso il software StepOne presente sul
computer co-locato.
Disposizione del sistema in cui lo Strumento StepOne non è collegato a un computer dal
cavo giallo del Sistema StepOne . Viene invece utilizzata un'unità USB ( ) per il
trasferimento dei dati tra i componenti del Sistema StepOne . In questa configurazione,
lo Strumento StepOne viene controllato attraverso il touchscreen dello strumento stesso.
Target che deve essere agli stessi livelli in tutti i campioni da testare. Utilizzato negli
esperimenti con curva standard relativa e C T (∆∆C T ) comparativo per la normalizzazione
dei segnali di fluorescenza per il target in corso di quantificazione. Noto anche come gene
di riferimento.
In esperimenti del Sistema StepOne , l'operazione assegnata ai target o ai saggi SNP in
pozzetti che contengono acqua o buffer invece di un templato di campione. Nei pozzetti
di controllo negativi non deve verificarsi alcuna amplificazione del target.
Negli esperimenti di genotipizzazione, l'operazione per il saggio SNP nei pozzetti che
contengono un templato di campione con un genotipo noto.
Negli esperimenti di presenza/assenza, templato di DNA sintetico di piccole dimensioni
che viene aggiunto alle reazioni della PCR. È possibile utilizzare l'IPC per distinguere tra
i risultati negativi e le reazioni influenzate dagli inibitori della PCR, dall'impostazione
errata del saggio o da un problema del reagente o dello strumento.
Vedere pozzetti IPC bloccati a controllo negativo.
Vedere controllo negativo (NC, Negative Control).
Abbreviazione per ciclo soglia.
Impostazione di analisi in cui il software calcola automaticamente la soglia e la linea di
base nel plot di amplificazione. Il software utilizza la soglia e la linea di base per calcolare
il ciclo soglia (C T ).
Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di
genotipizzazione
RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.
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