Applied Biosystems StepOne™ System Real-Time PCR System ...

Capitolo 5 Analisi dell'esperimento
Visulizzazione del Plot di discriminazione allelica
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Linee guida
analisi
Per analizzare il proprio esperimento:
• Verificare che tutti i controlli presentino il genotipo corretto.
• Nel caso si utilizzino controlli positivi, verificare le richieste per i controlli positivi:
a. Nella tabella pozzetti, selezionare i pozzetti contenenti un controllo positivo
per evidenziare i datapoint corrispondenti nel Plot di discriminazione allelica.
b. Verificare che i datapoint per i controlli positivi siano raggruppati lungo l'asse
appropriato del plot. Ad esempio, se viene selezionato l'allele 1 controllo
positivo/allele 1, i controlli si raggrupperanno lungo l'asse X.
c. Ripetere i passaggi a e b per i pozzetti contenenti gli altri controlli positivi.
• Visualizzare il cluster dei controlli negativi per i campioni non noti la cui
amplificazione sia non riuscita:
a. Selezionare i datapoint del cluster nell'angolo in basso a sinistra del Plot di
discriminazione allelica per selezionare le righe corrispondenti della tabella
pozzetti.
b. Verificare che i pozzetti selezionati nella tabella pozzetti siano controlli
negativi e non campioni non noti.
Note
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Guida introduttiva al sistema Applied Biosystems StepOne Real-Time PCR System per gli esperimenti di
genotipizzazione
RISERVATO - Esclusivamente per uso interno AB. Non distribuire.