Universidade Federal de Minas Gerais Instituto de Ciências ...

DORELLA, F. A.; ESTEVAN, E. M.; PACHECO, L. G. C.; GUIMARÃES, C. T.; LANA,
U G P; GOMES, e A; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MIYOSHI, A.; AZEVEDO, V. In
vivo insertional mutagenesis in Corynebacterium pseudotuberculosis: an efficient
means to identify DNA sequences encoding exported proteins. Applied and
Environmental Microbiology, Holanda, v. 72, p. 7368-7372, 2006.
O Projeto Genoma de C. pseudotuberculosis foi, então, aprovado pela
RGMG, tem apoio financeiro do CNPq e da FAPEMIG, os quais têm possibilitado a
realização do mesmo, sob a identificação de número 2829/05, autorizando o uso de
quase dois milhões de reais para que os objetivos do projeto sejam alcançados. Os
dados desse projeto em andamento podem ser visitados no sítio eletrônico
http//:rgmg.cpqrr.fiocruz.br.
A escolha do patógeno em questão foi baseada em sua grande importância
econômica e veterinária e em todo o trabalho preparatório para o seqüenciamento
do genoma pelo nosso grupo. Adicione-se a isso o fato de, anualmente, haver um
crescimento de cerca de 4% em projetos genomas de actinobactérias no mundo,
visto que esse grupo reúne diversos gêneros de grande relevância médica,
biotecnológica e veterinária.
Começamos, então, pelo método tradicional de seqüenciamento, ou seja, o
método de Sanger, e, com o intuito de se testarem novas tecnologias de
seqüenciamento, por interesse nosso, foi também realizado o seqüenciamento por
meio do sistema de piroseqüenciamento com a tecnologia 454. O teste mostrou que
a tecnologia tradicional de seqüenciamento de Sanger e o piroseqüenciamento são
complementares, possibilitando maior cobertura do genoma e, por conseguinte, uma
evolução mais acelerada do projeto. Fomos também pioneiros no Brasil a usar a
tecnologia de piroseqüenciamento.
O trabalho de seqüenciamento de C. pseudotuberculosis está em fase de
anotação do genoma, com previsão de término em agosto de 2008. A composição
geral do genoma, até então obtida, é de GC (52.2%). A predição do genoma é de
2.338 genes e tamanho final esperado de 2.782.914pb. Já aprovamos o
seqüenciamento de C. ulcerans, que começará em breve. Sequenciaremos uma
linhagem que matou uma anciã no Rio de Janeiro e foi o primeiro caso no Brasil.
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