Sprawozdanie za 2012 rok - Portal Wiedzy PAN - Polska Akademia ...
Sprawozdanie za 2012 rok - Portal Wiedzy PAN - Polska Akademia ...
Sprawozdanie za 2012 rok - Portal Wiedzy PAN - Polska Akademia ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
* 31-512 Kraków, ul. Lubicz 46<br />
( (12) 421-51-44, fax (12) 421-97-90<br />
: e-mail: ibpan@botany.pl<br />
www.botany.pl<br />
INSTYTUT CHEMII BIOORGANICZNEJ<br />
<strong>PAN</strong><br />
Dyrektor: prof. dr hab. Marek Figlerowicz<br />
Przewodniczący Rady Naukowej: czł. rzecz.<br />
<strong>PAN</strong> Andrzej B. Legocki<br />
Instytut (kategoria „1” (A) w rankingu MNiSW)<br />
<strong>za</strong>trudnia 180 pracowników, w tym 71 naukowych<br />
(<strong>za</strong>trudnienie średnioroczne w przeliczeniu<br />
na pełne etaty).<br />
Działalność naukowa: opublikowano łącznie<br />
160 prac, z tego 76 prac w recenzowanych c<strong>za</strong>sopismach<br />
naukowych o <strong>za</strong>sięgu międzynarodowym;<br />
realizowano: 71 projektów badawczych,<br />
w tym 20 <strong>za</strong>granicznych, 34 <strong>za</strong>dania badawcze<br />
w ramach działalności statutowej; we współpracy<br />
z <strong>za</strong>granicą realizowano 30 tematów.<br />
Wybrane wyniki:<br />
• Ostra białaczka szpikowa (AML, ang. acute<br />
myeloid leukemia) jest złośliwą, klonalną, bardzo<br />
heterogenną genetycznie, chorobą tkanki krwiotwórczej.<br />
AML charakteryzuje się upośledzonym<br />
wytwar<strong>za</strong>niem prawidłowych elementów morfotycznych<br />
krwi, akumulacją nieprawidłowych<br />
komórek zwanych blastami oraz naciekaniem<br />
różnych narządów i tkanek. Przez wiele lat diagnostyka<br />
AML prowadzona była głównie w oparciu<br />
o klasyczne badania laboratoryjne krwi (ocena<br />
morfologiczna i cytochemiczna komórek białaczkowych).<br />
Nie pozwalają one precyzyjnie różnicować<br />
poszczególnych typów AML, dodatkowo<br />
charakteryzują się niską wartością predykcyjną.<br />
Stąd konieczne są dalsze badania zmier<strong>za</strong>jące<br />
do wyjaśnienia mechanizmów molekularnych<br />
leżących u podstaw transformacji białaczkowych<br />
oraz stworzenia nowych metod diagnostyki oraz<br />
terapii AML. W ramach badań realizowanych<br />
w CENAT ICHB <strong>PAN</strong> przeprowadzono szczegółową<br />
analizę proteomiczną białek izolowanych<br />
z krwi oraz szpiku chorych na ostrą białaczkę<br />
szpikową typu M1 i M2. W rezultacie stworzone<br />
zostały mapy charakteryzujące proteom blastów<br />
występujących w AML M1 i M2. Ponadto zidentyfikowano<br />
szereg potencjalnych biomarkerów<br />
białkowych mogących znaleźć <strong>za</strong>stosowanie<br />
w diagnostyce ostrych białaczek szpikowych.<br />
• Opracowano nową metodę automatycznego<br />
przewidywania struktur 3D RNA w oparciu o ich<br />
strukturę drugorzędową. Jej koncepcja opiera się<br />
na systemie maszynowego tłumaczenia (ang. machine<br />
translation) wykorzystującym bazę RNA<br />
FRABASE przekształconą w słownik elementów<br />
drugorzędowych i przestrzennych RNA. Metoda<br />
została udostępniona poprzez serwery RNAComposer<br />
w oparciu o jeden procesor. RNAComposer<br />
generuje struktury przestrzenne o zminimalizowanej<br />
energii w ciągu kilku sekund. Metoda ma<br />
charakter ogólny i nie wymaga dostępu do cząsteczek<br />
referencyjnych RNA o ustalonej eksperymentalnie<br />
strukturze przestrzennej, jak to ma<br />
miejsce w przypadku modelowania homologicznego<br />
RNA.<br />
• Wyka<strong>za</strong>no istnienie w rejonie 682-744nt.<br />
mRNA segmentu 7, <strong>za</strong>wierającego miejsce 3'<br />
splicingu, konserwatywnego motywu strukturalnego<br />
dla grypy typu A. Mapowania chemiczne<br />
i mikromacierzowe ujawniły równowagę konformacyjną<br />
tego RNA pomiędzy strukturą spinki<br />
i pseudowęzła. Prawdopodobnie jest to element<br />
regulacji splicingu. Zaproponowano także po raz<br />
pierwszy struktury drugorzędowe vRNA segmentów:<br />
8 (875nt.) i 7 (1027nt.) wirusa grypy. Poznanie<br />
struktury drugorzędowej vRNA jest istotne<br />
dla zrozumienia funkcji biologicznych RNA,<br />
procesu tworzenia wirionu oraz projektowania<br />
potencjalnych terapeutyków.<br />
Uzyskana habilitacja:<br />
Marcin Chmielewski Termolabilne grupy ochronne<br />
w chemicznej syntezie związków o znaczeniu<br />
biologicznym.<br />
Uzyskane doktoraty:<br />
Ewelina Adamska Poszukiwanie nowych inhibitorów<br />
epigenetycznych jako potencjalnych leków<br />
przeciwnowotworowych;<br />
Agnieszka Fiszer Badania procesu interferencji<br />
RNA sekwencji powtórzonych CAG i CUG w kontekście<br />
terapii choroby Huntingtona i niektórych<br />
ataksji rdzeniowo-móżdżkowych;<br />
– 76 –
Change language