NGHIÊN CỨU LÝ THUYẾT LIÊN KẾT HYDRO X–H∙∙∙O/N (X = C, N) BẰNG PHƯƠNG PHÁP HÓA HỌC LƯỢNG TỬ

132
tổng bán kính Van der Waals của 2 nguyên tử H và O (2,72 Å) và 2 nguyên tử H và
N (2,75 Å). Riêng tương tác N10∙∙∙H16 ở phức C-G4 có khoảng cách là 3,02 Å, hơi
lớn hơn tổng bán kính Van der Waals của chúng, là do sự bổ trợ của liên kết hydro
N14–H29∙∙∙O12.
Mặt khác, năng lượng tương tác của các phức thu được đều khá âm,
trong khoảng từ -7,6 đến -23,3 kcal.mol -1 khi hiệu chỉnh ZPE và từ -7,4 đến -
22,7 kcal.mol -1 khi hiệu chỉnh cả ZPE và BSSE, minh chứng các phức hình
thành của tương tác giữa cytosine và guanine rất bền. Kết quả thu được cho
thấy độ bền các phức giảm dần theo thứ tự: C-G7 > C-G5 > C-G6 > C-G2 >
C-G3 > C-G4 > C-G1 (bảng 3.39).
Bảng 3.39. Năng lượng tương tác của các phức giữa cytosine và guanine tại
B3LYP/6-311++G(2d,2p)
Phức ∆E (kcal.mol -1 ) ∆E * (kcal.mol -1 )
C-G1 -7,6 -7,4
C-G2 -11,3 -10,9
C-G3 -10,2 -10,1
C-G4 -9,2 -8,8
C-G5 -20,8 -20,3
C-G6 -12,5 -12,1
C-G7 -23,3 -22,7
Để đánh giá ảnh hưởng của độ phân cực liên kết N–H, C–H và độ bazơ tại
nguyên tử O/N trong các monome đến bộ bền của tương tác cũng như độ bền của
phức hình thành, chúng tôi tính enthalpy tách proton của liên kết N–H, C–H (DPE,
kcal.mol -1 ) và ái lực proton tại nguyên tử O/N (PA(O/N), kcal.mol -1 ) tại mức lý
thuyết B3LYP/6-311++G(2d,2p), và các kết quả chỉ ra ở bảng 3.40.