2003/2004 - Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten - Uppsala ...

UPPSALA UNIVERSITET STUDIEHANDBOK 2003/04
Uppsala tekniska högskola
Civilingenjörsprogrammen
Kursplaner
Lärande system för molekylär dataanalys, 6 poäng
Learning Systems for Molecular Data Analysis
1MB452
Kursplanen är fastställd 2000-06-02 av teknisk- naturvetenskapliga fakultetsnämnden och
senast reviderad 2003-05-16 av teknisk- naturvetenskapliga fakultetsnämnden
Kursen ges inom Civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik
Studieperiod: Kursen ges i Period 43
Mål för utbildningen Kursen syftar till att ge grundläggande kunskaper och förståelse för hur
olika typer av lärande system kan användas för problem inom molekylär datanalys. Målet
med denna kurs är också att skapa en grundläggande förståelse för hur olika typer av lärande
system kan användas för att lösa bioinformatiska problem.
Kursens innehåll
Matematiska grunder för lärande system. Grundläggande koncept som Bayesiansk
modellering, parametriska och icke-parametriska metoder, diskriminantfunktioner,
beslutsytor, parameterestimering, övervakad och oövervakad inlärning, interaktiva lärande
system, generalisering, klustring. Familjer av metoder som beslutsträd, artificiella neuronnät,
Bayesianskt lärande och prototyp-baserat lärande. lärande system för sekvensanalys,
dynamisk programmeering, EM-algoritmen, Markov Chain Monte Carlo metoder, simulated
annealing, evolutionära och genetiska algoritmer, gömda markov-kedjor, fylogenetiska träd,
stokastiska grammatikor. Allt integrerat med tillämpningar inom molekylär bioinformatik.
Laborationer: Datorlaborationer med verkliga och syntetiska data.
Särskild behörighet Algebra och geometri. Flerdimensionell analys. Matematisk statistik.
Numerisk analys. Molekylär bioinformatik.Genfunktion.
Undervisningsform Föreläsningar, seminarier och laborationer.
Examinationsform Skriftlig tentamen vid kursens slut, inlämningsuppgifter. I kursen
ingående övningar och laborationer som är poängsatta med 2 poäng.
Betyg Något av betygen, underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4) och med
beröm godkänd (5).
Övriga föreskrifter
Omtentamen i betygshöjande syfte kan ej ske efter att sammanfattningsbetyg på kursen satts.
Kurslitteratur Webb, A., Statistical Pattern Recognition, 2nd ed., 2002.
Utdrag ur böcker och artiklar.
Nivå: Kursen ges på D-nivå
Ämne: Kursen ges inom huvudämnet Biologi och inom huvudämnet Teknik
Kursansvarig institution
Institutionen för teknikvetenskaper
306