2003/2004 - Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten - Uppsala ...

More documents

Recommendations

Info

UPPSALA UNIVERSITET STUDIEHANDBOK 2003/04 Uppsala tekniska högskola Civilingenjörsprogrammen Kursplaner Molekylär bioinformatik, 3 poäng Molecular Bioinformatics 1MB330 Kursplanen är fastställd 1997-05-15 av Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden och senast reviderad 2002-04-15 av teknisk- naturvetenskapliga fakultetsnämnden Kursens placering i utbildningsprogram Kursen ges inom Civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik Studieperiod: Kursen ges i Period 33 Mål för utbildningen Kursen skall ge grundläggande kunskaper och förståelse för den teori (strukturbiologi, enzymologi, mönsterigenkänning) som ligger till grund för utveckling av nya bioinformatiska analysverktyg. Kursen skall också ge färdigheter i hur bioinformatiska verktyg används i praktiken och hur den underliggande teorin kan utnyttjas för att tolka resultaten från olika analyser. Kursens innehåll Biologiska databaser, servrar och informationscentra. Grundläggande makromolekylär struktur: tredimensionell struktur, PDB-koordinater, klassificering av proteiner i strukturfamiljer, program för modellbygge. Introduktion till teorin för klassificering och jämförelse av sekvenser och extraktion av gemensamma särdrag (t.ex. motiv). Datormodellering av tredimensionell struktur baserad på sekvensdata; sekvensanalys för modellering av sekundär och tertiär struktur. Introduktion till hur metoder för mönsterigenkänning som lär sig från exempel (t.ex. gömda markovmodeller och artificiella neuronnät) kan användas för utveckling av nya bioinformatiska analysverktyg. Särskild behörighet Organisk kemi med analytiska tekniker. Cellbiologi. Termodynamik. Programmeringsteknik och numerisk analys. Matematisk statistik Undervisningsform Föreläsningar och datorövningar Examinationsform Hemuppgifter och skriftligt prov vid kursens slut. I kursen ingående laborationer/övningar är poängsatta med 1 poäng. Betyg: Något av betygen underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4) och med beröm godkänd (5) Kurslitteratur Lesk A.M.: Introduction to Bioinformatics, Oxford University Press, 2002. Vetenskapliga artiklar, utdrag från läroböcker, stenciler och kompendium med allmän information om bioinformatiska resurser på Internet Nivå: Kursen ges på C-nivå Ämne: Kursen ges inom huvudämnet Biologi, Kemi och Teknik Kursansvarig institution Institutionen för biologisk grundutbildning 350
UPPSALA UNIVERSITET STUDIEHANDBOK 2003/04 Uppsala tekniska högskola Civilingenjörsprogrammen Kursplaner Molekylär cellbiologi, 4 poäng Molecular Cell Biology 1TK056 Kursplanen är fastställd 2002-04-27 av teknisk- naturvetenskapliga fakultetsnämnden och senast reviderad 2003-05-03 av teknisk- naturvetenskapliga fakultetsnämnden Kursen ges inom Civilingenjörsprogrammet i kemiteknik Studieperiod: Kursen ges i Period 31 Mål för utbildningen Att ge kunskap utöver den mest basala nivån om struktur, funktion och genetik hos celler och virus. Kursen ska ge en grund för fördjupning inom ämnet, angränsande eller tillämpad biovetenskap. Kursens innehåll - Eukaryota cellers struktur. Makromolekyler/Biopolymerer som byggstenar för celler. Kärna, organeller, membransystem och filament. – Genomets struktur och funktion. Arvsmassans organisation och evolution, DNA struktur, syntes, replikation och reparation. Mobil- och repeterad DNA. - Genuttryck; från DNA till protein. Transkription, RNA maturering och transport, RNA metabolism och proteinbiosyntes. Mekanismer av genreglering. Genreglering, en integrerad flerstegsprocess. - Intracellulära kompartmenter och transport. Proteinernas sortering och transport till olika organeller. Posttranslationell modifiering. - Biologiska membran och cell kommunikation. Mekanismer för transport över cellmembran och cell signalering. G-protein kopplade receptorer, enzymkopplade receptorer, intracellulära receptorer. - Koppling av cellens signalvägar till reglering av genuttryck. Receptorer som transkriptionsfaktorer. Signalvägar och posttranskriptionell genreglering. - Cytoskelett: roll i cellens struktur och funktion. - Celldelning, cellcykeln och cell differentiering. - Cell-cell interaktioner, tumörbiologi och apoptos. Särskild behörighet Organisk kemi. Biokemi Undervisningsform Föreläsningar, seminarier och grupparbeten med inslag av problemorienterad undervisning. Examinationsform Skriftligt prov vid kursens slut. Betyg: Något av betygen underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4) och med beröm godkänd (5). Övriga föreskrifter All undervisning utom föreläsningar (där närvaro rekommenderas) är obligatorisk. Kurslitteratur Essential Cell Biology; An introduction to the molecular biology of the cell. Alberts et al editors, 1998, Garland Publishing, Inc., ISBN 0-8153-2045-0. Nivå: Kursen ges på AB-nivå Ämne: Kursen ges inom huvudämnet Biologi Kursansvarig institution Institutionen för farmaceutisk biovetenskap 351
Page 1 and 2:
Studiehandbok för civilingenjörsp
Page 3 and 4:
UPPSALA UNIVERSITET STUDIEHANDBOK 2
Page 5 and 6:
Page 7 and 8:
Page 9 and 10:
Page 11 and 12:
Page 13 and 14:
Page 15 and 16:
Page 17 and 18:
Page 19 and 20:
Page 21 and 22:
Page 23 and 24:
Page 25 and 26:
Page 27 and 28:
Page 29 and 30:
Page 31 and 32:
Page 33 and 34:
Page 35 and 36:
Page 37 and 38:
Page 39 and 40:
Page 41 and 42:
Page 43 and 44:
Page 45 and 46:
Page 47 and 48:
Page 49 and 50:
Page 51 and 52:
Page 53 and 54:
Page 55 and 56:
Page 57 and 58:
Page 59 and 60:
Page 61 and 62:
Page 63 and 64:
Page 65 and 66:
Page 67 and 68:
Page 69 and 70:
Page 71 and 72:
Page 73 and 74:
Page 75 and 76:
Page 77 and 78:
Page 79 and 80:
Page 81 and 82:
Page 83 and 84:
Page 85 and 86:
Page 87 and 88:
Page 89 and 90:
Page 91 and 92:
Page 93 and 94:
Page 95 and 96:
Page 97 and 98:
Page 99 and 100:
Page 101 and 102:
Page 103 and 104:
Page 105 and 106:
Page 107 and 108:
Page 109 and 110:
Page 111 and 112:
Page 113 and 114:
Page 115 and 116:
Page 117 and 118:
Page 119 and 120:
Page 121 and 122:
Page 123 and 124:
Page 125 and 126:
Page 127 and 128:
Page 129 and 130:
Page 131 and 132:
Page 133 and 134:
Page 135 and 136:
Page 137 and 138:
Page 139 and 140:
Page 141 and 142:
Page 143 and 144:
Page 145 and 146:
Page 147 and 148:
Page 149 and 150:
Page 151 and 152:
Page 153 and 154:
Page 155 and 156:
Page 157 and 158:
Page 159 and 160:
Page 161 and 162:
Page 163 and 164:
Page 165 and 166:
Page 167 and 168:
Page 169 and 170:
Page 171 and 172:
Page 173 and 174:
Page 175 and 176:
Page 177 and 178:
Page 179 and 180:
Page 181 and 182:
Page 183 and 184:
Page 185 and 186:
Page 187 and 188:
Page 189 and 190:
Page 191 and 192:
Page 193 and 194:
Page 195 and 196:
Page 197 and 198:
Page 199 and 200:
Page 201 and 202:
Page 203 and 204:
Page 205 and 206:
Page 207 and 208:
Page 209 and 210:
Page 211 and 212:
Page 213 and 214:
Page 215 and 216:
Page 217 and 218:
Page 219 and 220:
Page 221 and 222:
Page 223 and 224:
Page 225 and 226:
Page 227 and 228:
Page 229 and 230:
Page 231 and 232:
Page 233 and 234:
Page 235 and 236:
Page 237 and 238:
Page 239 and 240:
Page 241 and 242:
Page 243 and 244:
Page 245 and 246:
Page 247 and 248:
Page 249 and 250:
Page 251 and 252:
Page 253 and 254:
Page 255 and 256:
Page 257 and 258:
Page 259 and 260:
Page 261 and 262:
Page 263 and 264:
Page 265 and 266:
Page 267 and 268:
Page 269 and 270:
Page 271 and 272:
Page 273 and 274:
Page 275 and 276:
Page 277 and 278:
Page 279 and 280:
Page 281 and 282:
Page 283 and 284:
Page 285 and 286:
Page 287 and 288:
Page 289 and 290:
Page 291 and 292:
Page 293 and 294:
Page 295 and 296:
Page 297 and 298:
Page 299 and 300:
Page 301 and 302:
Page 303 and 304:
Page 305 and 306:
Page 307 and 308:
Page 309 and 310: UPPSALA UNIVERSITET STUDIEHANDBOK 2
Page 359: UPPSALA UNIVERSITET STUDIEHANDBOK 2
Page 411 and 412:
Page 413 and 414:
Page 415 and 416:
Page 417 and 418:
Page 419 and 420:
Page 421 and 422:
Page 423 and 424:
Page 425 and 426:
Page 427 and 428:
Page 429 and 430:
Page 431 and 432:
Page 433 and 434:
Page 435 and 436:
Page 437 and 438:
Page 439 and 440:
Page 441 and 442:
Page 443 and 444:
Page 445 and 446:
Page 447 and 448:
Page 449 and 450:
Page 451 and 452:
Page 453 and 454:
Page 455 and 456:
Page 457 and 458:
Page 459 and 460:
Page 461 and 462:
Page 463 and 464:
Page 465 and 466:
Page 467 and 468:
Page 469 and 470:
Page 471 and 472:
Page 473 and 474:
Page 475 and 476:
Page 477 and 478:
Page 479 and 480:
Page 481 and 482:
Page 483 and 484:
Page 485 and 486:
Page 487 and 488:
Page 489 and 490:
Page 491 and 492:
Page 493 and 494:
Page 495 and 496:
Page 497 and 498:
Page 499 and 500:
Page 501 and 502:
Page 503 and 504:
UPPSALA UNIVERSITET BESLUT UFV 2003
show all

2003/2004 - Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten - Uppsala ...

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?