PhD download - hirc.botanic.hr, Department of Botany, Faculty of ...

More documents

Recommendations

Info

Metode grupiranja podataka (Cluster analiza)Cluster analiza korištena je za utvrđivanje biološke udaljenosti među prvobitnoneklasificiranim objektima (Everitt 1981, Legendre i Legendre 1998, Quinn i Keough2002), u ovom slučaju populacijama. Korištena je UPGMA aglomerativna hijerarhijskametoda, kojom se istovremeno samo jedna operacijska taksonomska jedinicagrupiranja (Operational Taxonomic Unit, OTU) pripaja drugoj. Ulazna informacija jeEuklidska matrica udaljenosti, a krajnji rezultat prikazan je dendrogramom. PrimjenomUPGMA metode biološke udaljenosti između objekata (populacija) procijenjene su kaoprosječne Euklidske udaljenosti između svih parova OTU-a u dva različita klasteravišedimenzionalnog prostora.FILOGENETIČKA OBRADA MOLEKULARNIH PODATAKAFilogenetička obrada molekularnih podataka izvršena je računalno, korištenjemprogramskog paketa PAUP 4.0b10 (Phylogenetic Analysis Using Parsimony; Swofford1993). Vrsta Edraianthus tenuifolius odabrana je kao kontrolna (out-group).Analiza parsimonije (Parsimony analysis)Prilikom analize parsimonije kao ulazni set podataka korištena je binarna matricadobivena prevođenjem restrikcijskih fragmenata, tako da je postojanje restrikcijskogmjesta kodirano s 1, a nepostojanje s 0 (Swofford 1993). Korištena je MULPARSopcija s jednostavnim “Stepwise” i “Tree Bisection Reconnection” (TBR) dodavanjemgrana. Izračunate informativne karakteristike rezultirale su određenim brojem jednakoparsimoničnih stabala (equally parsimonious trees). Iz «najparsimoničnijih» (mostparsimonious trees) među njima generiran je konačno jedan kladogram (50%-majority-rule consensus tree) korištenjem CONTREE komande. Bootstrap-vrijednosti[BS], koje ukazuju na vjerojatnost filogenetičke srodnosti određenih grana, izračunatesu korištenjem BOOTSTRAP komande.30
Metoda najbližeg susjeda (Neighbour-joining tree, NJ)Kao dodatak analizi parsimonije korištena je Metoda najbližeg susjeda.Binarna matrica podataka upotrijebljena je za izračunavanje genetske udaljenostiizmeđu OTU-a primjenom Nei i Li koeficijenta (Nei i Li 1979). Dobivena matricagenetskih udaljenosti obrađena je metodom najbližeg susjeda (neighbour-joining tree,NJ - Swofford 1993), a rezultat prikazan filogenetskim stablom.31
Page 1 and 2: Sveučilište u ZagrebuPrirodoslovn
Page 3 and 4: SADRŽAJTemeljna dokumentacijska ka
Page 5 and 6: TEMELJNA DOKUMENTACIJSKA KARTICASve
Page 7 and 8: 1.1 Red i porodica zvončića1. UVO
Page 9 and 10: 1.2 Rod zvončića (Campanula L.)Im
Page 11 and 12: nije bilo poznato da postoje vrste
Page 13 and 14: 2002), pa i u vrstama roda Campanul
Page 15 and 16: isophylla - Prilog 1, sl. 7). Ta je
Page 17 and 18: 2. CILJ ISTRAŽIVANJAKako je razvrs
Page 19 and 20: Biljni materijal za morfometrijsku
Page 21 and 22: Listovi za DNA-izolaciju prikupljen
Page 23 and 24: Devet mjerenih kvantitativnih morfo
Page 25 and 26: Elektroforeza u gelu agarozeElektro
Page 27 and 28: Tablica 3.1. Parametrijski i nepara
Page 29: Vrijednost Wilks' Lambda koeficijen
Page 33 and 34: Tablica 4.1. Korelacije vremenskog
Page 35 and 36: Tablica 4.3 Rezultati neparametrijs
Page 37 and 38: 98765432dužina zubaca èaške (SEP
Page 39 and 40: 4,54,0Mean Mean±SE Mean±SD3,5, mm
Page 41 and 42: 5,55,0Mean Mean±SE Mean±SD4,54,03
Page 43 and 44: 87Mean Mean±SE Mean±SD65432širin
Page 45 and 46: 2422Mean Mean±SE Mean±SD, mm) L20
Page 47 and 48: 2220Mean Mean±SE Mean±SD181614121
Page 49 and 50: 1098Mean Mean±SE Mean±SD7, mm) AN
Page 51 and 52: Rezultati Kruskal-Wallisove univari
Page 53 and 54: Osi 1-6 imaju α ≤ 0,05, što zna
Page 55 and 56: Slika 4.20 Scatter grafikon primjer
Page 57 and 58: Tablica 4.7 Eigen-vrijednosti i kum
Page 59 and 60: Metode grupiranja podataka (Cluster
Page 61 and 62: 4.2 Analiza materijala za molekular
Page 63 and 64: Slika 4.26. Restrikcija kloroplastn
Page 65 and 66: Garganicae«izofiloidi»(«heterofi
Page 67 and 68: 5. RASPRAVA5.1. Usporedbena morfome
Page 69 and 70: pripr.), naznačuju neobičan polo
Page 71 and 72: sigurnošću korištene u determina
Page 73 and 74: Waldsteiniana imaju jasnu (mada če
Page 75 and 76: kao što je C. cespitosa. Ta sličn
Page 77 and 78: 5.2 Evolucija morfoloških karakter
Page 79 and 80: obliku. Moja iskustva s prirodnih s
Page 81 and 82:
Drugo, slabo poznata skupina «izof
Page 83 and 84:
vrstama nejasne filogenije bez obzi
Page 85 and 86:
garganica na Monte Garganu, s izraz
Page 87 and 88:
Engelskoj naturalizirana vrsta (Cro
Page 89 and 90:
što su im areali bili razdijeljeni
Page 91 and 92:
6. ZAKLJUČCITemeljem provedenih us
Page 93 and 94:
Buzas, G., 1998: Provisorischer Sch
Page 95 and 96:
Frizzi G., Tammaro, F., 1991: Elect
Page 97 and 98:
Kovačić, S., 2004: The genus Camp
Page 99 and 100:
Phitos, D., Kamari, G., 1988: Contr
Page 101 and 102:
Trinajstić, I., 1991: O problemu g
show all

PhD download - hirc.botanic.hr, Department of Botany, Faculty of ...

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?