PhD download - hirc.botanic.hr, Department of Botany, Faculty of ...

Slika 4.26. Restrikcija kloroplastnih trnT-trnF regija osam vrsta roda Campanula upotrebomrestrikcijskog enzima HinfI. Pruga 1. = DNA veličinski standard IX (Roche) 2. C.rotundifolia s.l., 3. C. carpatica, 4. C. hercegovina, 5. C. pyramidalis, 6. C. fenestrellatas.s., 7. C. tommasiniana, 8. C. portenschlagiana, 9. C. waldsteiniana,10. DNA veličinskistandard VII (Roche).FILOGENETIČKA OBRADA MOLEKULARNIH PODATAKAAnaliza parsimonijeNakon što su su dobiveni restrikcijski fragmenti prevedeni u binarnu matricu(1=fragment prisutan, 0=fragment odsutan) izlazna matrica podataka sadržavala jeukupno 26 svojti i 73 binarne karakteristike (Prilog 14). Wagnerova analiza parsimonijetog seta podataka sadrži 14 konstantnih i 20 varijabilnih karakteristika, neinformativnihza potrebe parsimonije. Ukupno 39 informativnih karakteristika rezultiralo je s 23jednako parsimonična kladograma (equally parsimonious trees) s dužinom od 89koraka, indeksom konzistencije (CI) 0,6629 (CI bez neinformativnihkarakteristika=0,5652), indeksom homoplazije (HI) 0,3371 (HI bez neinformativnihkarakteristika=0,4348) i indeksom retencije (RI) 0,8636. Kladogram (50%-majority-ruleconsensus tree) generiran iz 23 «najparsimoničnijih» dendrograma (mostparsimonious trees) prikazan je na Slici 4.27. Očito je grupiranje uključenih svojti u63