Revista Newslab Edição 179

DNBSEQ-G99:
Aplicação em Oncologia
Detecção de Variantes Raras
Amostra: ctDNA de câncer de pulmão diluído
a 1%, 0,5%, 0,2%, e 0,1%.
Biblioteca: Kit de preparo por captura.
Estratégia: PE100 dual-barcode.
Objetivo: Testar a capacidade de detecção de
variantes do DNBSEQ-G99.
Data of AF_1% ctDNA
Data of AF_0.5% ctDNA
5
4
3
Resumo do
sequenciamento
Detected AF%
3
2
1
Detected AF%
2
1
As corridas geraram
126M reads em média e
Q30>93%, com uma
ótima reprodutibilidade.
0
1.5
0 2 4 6
Expected AF%
Data of AF_0.2% ctDNA
0
0 2 4 6
Expected AF%
Data of AF_0.1% ctDNA
0.6
Resumo das análises
Detecção de SNVs em
100% dos sítios para
todas as amostras
(1%, 0,5%, 0,2%, 0,1%).
Detected AF%
1.0
0.5
Detected AF%
0.4
0.2
Cada sequenciamento
foi finalizado em cerca
0
0 0.5
1.0 1.5
0.0
0.0 0.2 0.4 0.6
de 9 horas!
Expected AF%
Expected AF%
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